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单细胞测序技术服务 靶向单细胞测序（lncRNA&mRNA） 单细胞测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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NGS测序技术服务 G4 Cut&Tag（DNA G4） G-loop检测 (G4&R-loop Cut&Tag) R-loop 测序（DRIPc-seq） |
基因芯片技术服务 RNA G-四联体 (rG4)芯片 |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序（eccDNA测序） |
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Ribo-seq Ribo seq（ribosome profiling） |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC-seq |
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蛋白表达定量 DIA定量蛋白质组学 Label free非标定量 TMT标记定量 PRM靶向定量 |
tRNA修饰测序- m1A/m3C/m1G/m2,2G可在单碱基分辨率水平上，一次性定量分析多种tRNA甲基化修饰（m1A、m3C、m1G、m2,2G）。这些甲基化修饰会破坏沃森-克里克碱基配对，在反转录过程中引发错配突变，通过测序对错配突变的检测，实现tRNA修饰位点和水平的定量分析。
为精确定量tRNA中的甲基化修饰位点，我们设置了去甲基化处理组（作为对照，去甲基化处理可以去除tRNA上的m1A、m3C、m1G、m2,2G修饰）与无处理组，通过对两组样品进行高效优化的tRNA测序分析，然后计算各碱基位点的甲基化诱导突变指数（Methylation-induced Mutation Index, MI），筛选无处理组突变率高而去甲基化处理组突变显著下降的位点，实现可靠的修饰位点识别与定量分析。在m1A、m3C、m1G及m2,2G修饰中，m1G与m2,2G可依据其在哺乳动物tRNA中的特征性分布位点进一步区分：m1G主要位于第9、37位碱基，而m2,2G则分布于第26位。
服务优势：
● 多修饰同步检测：可同时定量分析tRNA中m1A、m3C、m1G及m2,2G四种甲基化修饰
● 高效去甲基化处理：高效的去甲基化处理能有效清除tRNA修饰m1A/m3C/m1G/m2,2G
● 单碱基分辨率定位：通过并行比对去甲基化处理与未处理的tRNA样本，精确定位m1A/m3C/m1G/m2,2G修饰位点
● 全维度表观转录组分析：同时实现修饰位点鉴定、甲基化水平定量与tRNA表达谱分析
● 高性能tRNA测序：采用深度优化的tRNA-seq技术和严格的质控流程突破常规tRNA测序瓶颈
● 一体化tRNA研究体系，无缝衔接多组学技术平台：包括tRNA PCR芯片、基于LC-MS的tRNA修饰分析、 tRF&tiRNA测序、tRF&tiRNA PCR芯片等
针对tRNA修饰检测，我们同时提供tRNA修饰测序- m1A/m3C/m1G/m2,2和small RNA修饰芯片服务。下图是两个平台的比较，可以帮助您更好的选择合适您研究目的的平台。
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tRNA 修饰测序 -m1A/m3C/m1G/m2,2G |
Small RNA 修饰芯片 |
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只适用于tRNA |
可检测多种小RNA分子类型，包括miRNAs、pre-miRNAs、tRNAs和tRFs & tiRNAs |
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单碱基分辨率定位修饰位点，对tRNA反密码子区及主体区域特定碱基位点的修饰进行精准解析，是研究tRNA修饰功能的关键依据 |
可实现修饰水平定量检测，但无法定位到单碱基位点 |
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一次性检测m1A、m3C、m1G、m2,2G四种甲基化修饰 |
每次项目只能检测一种修饰类型 |
图1. tRNA修饰测序技术流程。通过对比去甲基化处理与不处理的tRNA样本在逆转录中产生的错配突变，实现m1A、m3C、m1G及m2,2G修饰的特异性识别。
火山图
