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蛋白质并非孤立存在的生物分子,而是具有特定三维空间结构并与其他蛋白质相互作用,共同执行功能。因此,蛋白质的模块及空间组织与其表达水平具有同样的重要性。为了解析蛋白质组的组织结构单元而开发的基于质谱的蛋白质组学方法通常结合了质谱检测与各种生化试验。使用特异性抗体 (CoIP-MS),在native条件下纯化与目标蛋白质相互作用的蛋白,进而使用质谱进行鉴定,通过test\control比对,过滤非特异结合蛋白,定性定量分析与特定蛋白质直接或间接作用的蛋白质。同时,结合 LFQ/TMT等定量技术,可以方便的研究特定蛋白互作关系随时间的变化情况。
	
	
	
| Sample | Amount | Antibody | 
|---|---|---|
| Tissue | >100mg | Yes | 
| Cell | >2×107 | Yes | 

