SRIC-MS

  • 简介
  • 技术优势
  • 实验流程
  • 结果展示
  • 参考文献
  • GlycoRNA是发生糖基化修饰的小非编码RNA。2021年,诺贝尔奖得主Bertozzi实验室首次在Cell报道哺乳动物RNA可发生糖基化修饰[1]。研究发现,glycoRNA主要定位于细胞膜表面,包括Y-RNA、tRNA、miRNA、snRNA、snoRNA、rRNA等多种RNA类型。

    膜表面glycoRNA可通过与Siglec、P-selectin等受体或膜蛋白相互作用,参与细胞通讯、免疫调控、炎症反应及肿瘤发生发展[2]。因此,解析glycoRNA结合蛋白,对于揭示其作用机制和疾病功能具有重要意义。


    图1. 膜表面glycoRNA作用机制——影响细胞通讯和信号传导[3]


    Aksomics提供SRIC-MS检测服务,利用Biotin探针特异性捕获细胞膜表面glycoRNA相关蛋白,并结合高分辨率质谱进行全面鉴定与定量分析[4],可高效解析glycoRNA相互作用网络,为免疫、炎症及肿瘤研究提供有力工具。

  • 1.特异性与灵敏度兼备:全面精确分析定位于细胞膜的glycoRNA的结合蛋白。实现了表面RNA的原位信号放大,显著提升低丰度glycoRNA结合蛋白的检测灵敏度,能够捕获传统方法难以检测的弱相互作用。
    2.非破坏性膜完整性维持:支保持细胞质膜完整,有效避免细胞破裂导致的细胞内RNA污染,确保所鉴定到的结合蛋白特异性来源于膜表面glycoRNA。
    3.专业的数据分析:标准的搜库流程,专业的统计和生信分析,出版级的图表展示,完整全面的分析报告。
    4.多组学联合分析兼容性:与Aksomics提供的glycoRNA芯片平台无缝联合,实现glycoRNA的筛选验证、机制研究全覆盖。
  • 1.样品准备:活细胞加入biotin标记探针孵育,紫外交联;
    2.免疫沉淀:细胞裂解,链霉亲和素C1磁珠富集,洗脱;
    3.质谱检测:RNase消化,蛋白回收,胰酶消化后质谱检测
    4.数据分析与结果报告
  • 1.SRIC-MS特异性富集的蛋白列表


    2.SRIC-MS特异性富集蛋白的GO/pathway分析


    3.SRIC-MS特异性富集蛋白的PPI互作网络图

  • 1.Flynn, Ryan A et al. Small RNAs are modified with N-glycans and displayed on the surface of living cells. Cell vol. 184,12 (2021): 3109-3124.e22.
    2.Yi, Li et al. GlycoRNA research: from unknown unknowns to known unknowns. Protein & cell vol. 17,2 (2026): 1-20.
    3.James V. Parsons. Exploring Foundational Experiments in GlycoRNA.
    4.Jiang X, Xu C, Yang E, et al. Small non-coding RNAs encapsulating mammalian cells fuel innate immunity. bioRxiv. Preprint posted online April 9, 2025.