单细胞组学

临床组织是各种细胞的混合物,以肿瘤为例,肿瘤中心细胞,边缘细胞和远端转移细胞的细胞类型及转录组存在差异。传统的bulk RNA-seq提取组织或一群细胞的混合RNA进行测序,得到所有细胞的平均基因表达,掩盖了单个细胞的表达特异性。

scRNA-seq能够有效解决细胞异质性问题,通过检测单个细胞的表达谱,鉴定细胞类群,深入研究肿瘤转移侵袭、瘤内异质性、微环境重编程和耐药,近几年来已广泛应用于肿瘤,免疫,生长,发育等生物研究领域。