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单细胞测序技术服务 靶向单细胞测序（lncRNA&mRNA） 单细胞测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序（eccDNA测序） |
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Ribo-seq Ribo seq（ribosome profiling） |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC-seq |
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蛋白表达定量 DIA定量蛋白质组学 Label free非标定量 |
N7-甲基鸟苷（m7G）是一种保守的tRNA修饰，主要位于特定tRNA可变环的第46位，由METTL1/WDR4甲基转移酶复合物催化生成。它通过形成C13–G22–m7G46碱基三联体，在维持tRNA结构完整性方面发挥着关键作用，从而保护tRNA免受快速降解途径的影响。在功能上，m7G对于胚胎发育过程中的干细胞自我更新和正确的谱系分化是不可或缺的[1]。此外，m7G修饰的tRNA能够提高密码子富集mRNA的翻译效率，特别是那些编码参与细胞周期进程、增殖和生长信号通路的致癌蛋白的mRNA。m7G修饰的失调——尤其是METTL1的过表达——会升高m7G修饰tRNA（如Arg-TCT-4-1、Lys-CTT、Val-AAC）的水平，从而驱动多种恶性肿瘤的发生，包括白血病、胶质母细胞瘤、胆管癌和肺癌[2-4]。
Aksomics全新推出的TRAC-Seq（tRNA reduction and cleavage sequencing）是一种基于化学法，能够以无偏倚、单核苷酸分辨率的方式对tRNA转录组中的m7G修饰进行图谱分析。m7G TRAC-Seq服务提供从样本到数据的完整解决方案。借助m7G TRAC-Seq分析所获得的数据结果，可以轻松推进该领域的下一步研究。
凭借在tRNA领域的丰富经验，m7G TRAC测序服务提供以下优势：
● 单核苷酸分辨率：能够以核苷酸级别的精度精确定位m7G位点
● 特异性高：依赖高度特异的化学反应而非抗体亲和力，消除了非特异性结合带来的背景干扰，并可进行定量化学计量评估
● 无偏倚定量和全面分析：可鉴定m7G位点、计算m7G修饰水平，并发现与修饰相关的motif序列
● 卓越的tRNA覆盖度：通过去甲基化处理，克服阻碍逆转录的tRNA修饰屏障，实现对高度修饰tRNA的高效测序
● 低样本量要求：仅需1-2.5μg来自多种生物样本（包括细胞、组织及体液样本）的小RNA即可进行实验
图1. m7G TRAC-Seq实验流程。分离获得的小RNA首先经过去甲基酶处理，以最大限度地减少背景干扰。随后，去甲基化的RNA依次用NaBH₄和苯胺处理，在m7G残基处诱导还原性切割。此过程产生带有可用于连接接头的，在m7G位点断裂的3'末端片段，进行 cDNA 文库构建。最后，通过高通量测序和生物信息学分析，利用跨 tRNA 转录组的裂解评分，实现对 m7G 位点的精确定位。
1.差异表达m7G-tRNA的火山图
2.用于m7G位点鉴定的m7G TRAC-seq reads比对图。
3.通过TRAC-seq鉴定的m7G motif分析。
1. Lin S et al: Mettl1/Wdr4-Mediated m(7)G tRNA Methylome Is Required for Normal mRNA Translation and Embryonic Stem Cell Self-Renewal and Differentiation. Mol Cell 2018, 71(2):244-255 e245.[PMID: 29983320]
2. El-Hachem, N., et al., Valine aminoacyl-tRNA synthetase promotes therapy resistance in melanoma. Nat Cell Biol, 2024. 26(7): p. 1154-1164.Orellana EA et al: METTL1-mediated m(7)G modification of Arg-TCT tRNA drives oncogenic transformation. Mol Cell 2021, 81(16):3323-3338 e3314.[PMID: 34352207]
3. Dai Z et al: N(7)-Methylguanosine tRNA modification enhances oncogenic mRNA translation and promotes intrahepatic cholangiocarcinoma progression. Mol Cell 2021, 81(16):3339-3355 e3338.[PMID: 34352206]
4. Ma J et al: METTL1/WDR4-mediated m(7)G tRNA modifications and m(7)G codon usage promote mRNA translation and lung cancer progression. Mol Ther 2021, 29(12):3422-3435.[PMID: 34371184]
