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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
产品列表
| 芯片 | 货号 | 规格 | 描述 |
|---|---|---|---|
| NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array | AS-NM-001-1 | 384 (4x96)-well plate | 同时检测85个tRNA修饰酶及相关蛋白因子 |
| NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480) | AS-NM-001-1-R | 384 (4x96)-well plate |
产品特点
• 覆盖度广—囊括了UniProt与Modomics中所有已知的tRNA修饰酶/蛋白因子
• 严谨性强—所有引物都通过了多样本严格验证
• 快速简易—即用型384孔板规格，只需将cDNA与qPCR
Master Mix混合试剂加入PCR板中，4小时内得到实验结果。cDNA无需预先扩增。
为保证NuRNA™ tRNA Modification Enzymes PCR芯片的实验效果，建议配套使用Arraystar rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (AS-FS-001) 和 Arraystar SYBR® Green Real-time qPCR Master Mix
tRNA是基因与蛋白之间重要的信息传递者，通过与特定氨基酸结合而发挥功能。越来越多的文献表明，tRNA及其来源的RNA片段（tRFs）在细胞增殖、分化、代谢、应激反应以及多种疾病中发挥着调控作用[1]。tRNA携带种类丰富、数目众多的转录后修饰。这些修饰为tRNA功能发挥所必需，参与tRNA的正确折叠，稳定维持和基因解码功能。比如，位于颈环部位的修饰影响tRNA的折叠与稳定性，反密码子环上的修饰确保翻译准确性，34号位置的修饰决着密码子的摆动性，反密码子环附近的修饰调控密码子与反密码子识别（图1）。
tRNA修饰受各类tRNA修饰相关蛋白的动态调控[2]，这些蛋白突变或者功能紊乱，与多种疾病的发生有关。例如，NSUN2负责催化胞嘧啶5’甲基化，其突变会导致机体头小畸形症；t6A甲硫基转移酶CDKAL1功能紊乱可诱发Ⅱ型糖尿病[3]。tRNA修饰对于疾病治疗的重要性，以及这些修饰是如何被调控，仍待进一步的研究[4,5]。
对于特定通路或聚焦领域中的基因而言，PCR芯片是其表达研究可靠便捷的手段。为了方便研究人员能够快速检测tRNA修饰相关蛋白的表达，Arraystar发布了聚焦tRNA修饰蛋白检测的PCR芯片—— Arraystar公司NuRNA™ tRNA Modification Enzymes PCR Array。参考已有文献与权威数据库（UniProt和Modomics），此款芯片囊括了85个tRNA修饰酶和蛋白因子，覆盖了所有已知的tRNA修饰酶。PCR芯片上的每对引物在多个组织和细胞系中通过了严格验证。
图1.人类tRNA修饰类型与修饰相关蛋白。
参考文献
[1] Kirchner S, Ignatova Z. Emerging roles of tRNA in adaptive translation, signalling dynamics and disease. Nature reviews Genetics 2015;16:98-112.
[2] El Yacoubi B, Bailly M, de Crecy-Lagard V. Biosynthesis and function of posttranscriptional modifications of transfer RNAs. Annual review of genetics 2012;46:69-95.
[3] Zhou B, Wei FY, Kanai N, Fujimura A, Kaitsuka T, Tomizawa K. Identification of a splicing variant that regulates type 2 diabetes risk factor CDKAL1 level by a coding-independent mechanism in human. Human molecular genetics 2014;23:4639-50.
[4] Zhang X, Cozen AE, Liu Y, Chen Q, Lowe TM. Small RNA Modifications: Integral to Function and Disease. Trends in molecular medicine 2016.
[5] Suzuki T, Nagao A, Suzuki T. Human mitochondrial tRNAs: biogenesis, function, structural aspects, and diseases. Annual review of genetics 2011;45:299-329.
表1.tRNA修饰酶/蛋白因子（修饰类型）
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tRNA修饰及相关蛋白(85): ADAT1(m1I37), ADAT2(m1I34), ADAT3(-), ALKBH1(mcm5U), ALKBH8(mchm5U34/mcm5s2U34/mcm5U34/mcm5Um34), C9orf64(-), CDK5RAP1(ms2A37/ms2 i6A37), CDKAL1(ms2A37/ms2 i6A37), CDKL1(ms2t6A), CTU1(mcm5S2U ), CTU2(mcm5S2U), DUS1L(D16/17), DUS2(D20), DUS3L(D47), DUS4L(D), ELP3(-), ELP4(mcm5s2U), FBLL1(-), FTSJ1(Cm32/Gm34), GTPBP3(tm5U34), HSD17B10(m1A9/m1G9), IKBKAP(-), KIAA0391(m1A9/m1G9), KIAA1456(Um), LAGE3(t6A37), LCMT2(o2yW), METTL1(m7G46), METTL2A(Cm), METTL2B(3mC), MOCS3(mcm5S2U ), MTO1(tm5U34), NAT10(Ac4C), NFS1(s2U34/tm5s2U34), NSUN2(m5C49), NSUN6(m5C72), OSGEP(t6A37), OSGEPL1(t6A37), PUS1(pseudouridine27/pseudouridine28), PUS10(pseudouridine 55), PUS3(pseudouridine39), PUS7L(pseudouridine), PUSL1(pseudouridine), QTRT1 (Q34), QTRT2 (Q34), RPUSD1(pseudouridine), RPUSD2(pseudouridine31/pseudouridine32), RPUSD3(pseudouridine), RPUSD4(pseudouridine31/pseudouridine32), SSB(-), TARBP1(-), THUMPD1(Acetylcytidine), THUMPD2(Gm), THUMPD3(Gm), TP53RK(t6A37), TPRKB(t6A37), TRDMT1(m5C38), TRIT1(i6A37), TRMO(m6t6A), TRMT1(m2G26/m22G26), TRMT10A(m1G9), TRMT10B(m1G9), TRMT10C(m1A9/m1G9), TRMT11(m2G10), TRMT112(mchm5U34/mcm5s2U34/mcm5U34/mcm5Um34), TRMT12(o2yW), TRMT13(m4C/m4A ), TRMT1L(m2G26/m22G26), TRMT2A(Um), TRMT2B(m5U54), TRMT44(Um44), TRMT5(m1G37/o2yW), TRMT6(m1A58), TRMT61A(m1A58), TRMT61B(m1A58), TRMU(s2U34/tm5s2U34), TRUB1(pseudouridine), TRUB2(pseudouridine55), TYW1(o2yW), TYW1B(o2yW), TYW3(o2yW), TYW5 (o2yW), UBA5(cyclic t6A), URM1(mcm5S2U), WDR4(m7G46), YRDC(t6A37) |
注：tRNA修饰缩写参考Modomics数据库，基因名参考UniProt。
适用的PCR仪：
ABI ViiA™ 7
ABI 7500 & ABI 7500 FAST
ABI 7900HT
ABI QuantStudio™ 6 Flex Real-Time PCR system
ABI QuantStudio™ 7 Flex Real-Time PCR system
ABI QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System
Bio-Rad CFX384
Bio-Rad iCycler & iQ Real-Time PCR Systems
Eppendorf Realplex
QIAGEN Rotor Gene Q 100
Roche Light Cycler 480
Stratagene Mx3000
Roche Light Cycler 480
Aksomics使用Arraystar的芯片为客户提供服务，以下为相关资料:
产品说明书： 
Manual_NuRNA™_Human_tRNA_Modification_Enzymes_PCR_Array_v1.02
分析工具： 
Analysis Tool for NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array_v1.0
