单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 RIME MS CoIP-MS |
NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序(MeRIP Seq) |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR(MazF酶切法)技术服务 |
Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
蛋白表达定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
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Aksomics(原康成生物)提供ChIP-qPCR服务,能够检测特定转录因子/组蛋白修饰与已知基因启动子区域的结合;在已知启动子范围内寻找特定转录因子/组蛋白修饰的结合位点。
ChIP-qPCR完美结合了ChIP技术和实时定量PCR技术。ChIP技术利用抗体特异性富集与特定转录因子/组蛋白修饰结合的DNA片段;qPCR技术使用SYBR荧光染料,非特异性的掺入DNA双链,发射荧光,保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步,最后利用Ct值进行定量分析。ChIP-qPCR能够专一,灵敏,快速,高重复地定量生物样品中特定转录因子/组蛋白修饰与已知基因启动子的结合。
● 高特异性,针对感兴趣的基因启动子设计特异性的实时荧光定量PCR引物;
● 超宽的线性范围,可跨越7个数量级;
● 精确度高,重复性好;
● 灵敏度高
实验流程
A. 样品交联,甲醛处理细胞,交联DNA与DNA结合蛋白
B. 超声打断染色质,裂解细胞,并以超声波将染色质打断成400-500bp的片段
C. 染色质免疫共沉淀,将B所得片段分成两份,一份与特异性抗体进行免疫共沉淀(ChIP),另一份作为Total input样品
D. DNA纯化,将C所得两份蛋白-DNA复合物解交联,纯化分离DNA片段。ChIP富集的DNA片段(ChIP DNA),Total input样品中的DNA片段(Total input DNA)
E. 实时荧光定量PCR检测
数据处理
● Total input DNA样品作为模板,用待测基因特异性引物进行qPCR,检测得到Ct值(Input)
● ChIP DNA样品作为模板,用待测基因特异性引物进行qPCR,检测得到Ct值(ChIP)
● 待测基因免疫共沉淀的效率(ChIP / Total input)可通过以下公式计算:
%(ChIP / Total input) = 2^[ Ct (Input)- Ct (ChIP) ] * 100