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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS |
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NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
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蛋白表达定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
相关服务
R-loop相关产品
相关资源
多种RNA形成R-Loop 调控基因表达R-loop是由转录的RNA链与打开的双链DNA其中一条模板链发生碱基互补配对，形成RNA-DNA杂合链，同时使未配对的另一条DNA链游离在外组成的三方结构 。它们分布广泛，占哺乳动物基因组的 5% 。R-loop经常出现在基因组的启动子和转录终止位点， 影响R-loop形成的结构因素包括高度的GC偏倚（GC skew，在TSS下游的非模板链上，G比C富集）、G四联体、DNA缺口和DNA/RNA修饰等。除了mRNA新生转录本外，lncRNA和circRNA均可形成R-Loop，在调节基因表达、DNA 复制以及 DNA 和组蛋白修饰方面发挥着重要作用，具有重要的生物学功能。
图1: R-loop的结构。
R-loop高通量筛选平台使用S9.6抗体来富集DNA:RNA杂交体后，进行建库和测序分析，实现精准的R-loop定位，并提供半定量信息。
严格的质控体系：设置阴性对照组和阳参，以控制文库质量。
稳定性高：实验操作稳定性高，减少实验操作带来的误差。
提供数据可视化，丰富的注释信息与文章发表级别的图谱。
1. 基因组DNA抽提
2. 超声片段化DNA
3. S9.6抗体免疫共沉淀
4. R-loop洗脱与cDNA第二链合成
5. R-loop 测序文库构建
6. 高通量测序
7. 数据分析
8. 提供实验报告
1.R-loop peak注释表
2. R-loop peak 在不同基因特征上的分布。
图：饼图显示了R-loop peak在每个基因特征上的数目和比例。
3. R-loop peak 在不同基因特征上的富集度
图：R-loop peak在不同基因组特征上的数目富集度和长度富集度。红色柱子：peaks占总peaks数目的占比,表示实际某基因特征的peak占比；蓝色柱子：基因组特征区长度占所有基因特征区长度总和的占比，这个柱子可以等同于随机分配情况下某基因特征内的peak占比。
4.R-loop peak在Genebody上的分布
图：R-loop peak在Genebody周围的分布。X轴表示到TSS或TES的距离，Y轴表示peak区的数目。
