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基因芯片技术服务 Small RNA芯片 piRNA芯片 染色质small RNA芯片 基因下游RNA（DoG RNA）芯片 lncRNA芯片 circRNA芯片 |
NGS测序技术服务 tRNA测序 tRF&tiRNA测序 miRNA测序 snoRNA测序 染色质small RNA测序 RNA测序 |
PCR芯片技术服务 nrStar™ ncRNA系列PCR芯片 NuRNA™ mRNA PCR芯片 |
PCR技术服务 lncRNA-qPCR circRNA-qPCR miRNA-qPCR tRF&tiRNA-qPCR mRNA-qPCR |
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单细胞测序技术服务 靶向单细胞测序（lncRNA&mRNA） 单细胞测序 |
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蛋白表达定量 DIA定量蛋白质组学 Label free非标定量 |
蛋白修饰定量 N-糖基化蛋白组学 O-GlcNAc修饰蛋白质组学 |
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Ribo-seq Ribo seq（ribosome profiling） |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序（eccDNA测序） |
对差异m6A基因/转录本进行qPCR验证是表观转录研究必不可少的步骤。康成生物提供与MeRIP-Seq相对应的MeRIP-PCR服务，保证最优的实验流程与最佳的技术方案。
图一. MeRIP-PCR实验流程图。
康成丨数谱生物服务特色：
●优化的实验流程
●特异性强的m6A抗体
●通过严格测试的引物
MeRIP-PCR既可对完整的m6A转录本（Intact）进行检测，也可对该转录本的m6A修饰区域（m6A-deposited Fragments）进行检测。
(Zhang et al., 2017, Cancer Cell 31, 1–16)
Normalize each MeRIP RNA fractions’ Ct value to the Input RNA fraction Ct value for the same qPCR Assay (ΔCt) to account for chromatin sample preparation differences. Calculate the % Input for each MeRIP fraction:
%Input=2(Ct Input-Ct MeRIP)×Fd×100% Here, Fd is Input dilution factor.
For example, if one- thirtieth of input mRNA and one-fifth of MeRIP mRNA were used for qPCR assays, Fd =5/30 =1/6
Fold Enrichment=2[ POS(CT Input-Ct MeRIP)-NEG (CT Input-Ct MeRIP) ]
|
sample |
Input-IP |
Input-neg |
IP/neg |
||||
|
input(Ct) |
IP(Ct) |
% |
input(Ct) |
neg(Ct) |
% |
||
|
2FVector C1 |
27.515 |
32.061 |
0.71 |
27.515 |
NA |
0.01 |
61.35 |
|
2F4E C3 |
27.287 |
32.885 |
0.34 |
27.287 |
NA |
0.01 |
34.65 |
|
2FVector C5 |
26.652 |
25.811 |
29.85 |
26.652 |
NA |
0.01 |
4669.09 |
|
2F4E C6 |
26.018 |
25.145 |
30.52 |
26.018 |
NA |
0.00 |
7408.39 |
|
2F4E C3/2FVector C1 |
|
0.48 |
|
0.85 |
|
||
|
2F4E C6/2FVector C5 |
|
1.02 |
|
0.64 |
|
||
