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RIME MS （Rapid immunoprecipitation mass spectrometry of endogenous proteins）服务旨在深入分析蛋白质在染色质和转录因子-转录辅因子复合物中的相互作用。这种高效的技术特别适合检测细胞核内蛋白质之间的相互作用，能够与ChIP-seq平行使用，为基因表达调控机制提供重要见解。
为什么选择RIME MS服务
· 揭示蛋白质功能和调控机制：通过将蛋白质作为完整复合物的一部分进行纯化和分析，RIME MS技术能够揭示其功能和调控机制，帮助理解特定相互作用蛋白的生物学相关性。
· 支持转录因子研究：转录因子（TFs）识别特定的DNA序列来控制染色质和转录，是基因表达调控的重要元素。研究表明，除了TF-DNA结合外，TFs与转录辅因子（TcoFs）的相互作用也是促进转录调控的重要组成部分。
· 填补研究空白：目前对TFs与TcoFs之间的关联研究相对较少。我们的RIME MS服务填补了这一空白，通过分析这些相互作用，帮助研究人员深入了解转录调控的复杂网络。
· 推动科学发现和应用：通过揭示染色质蛋白质-蛋白质相互作用的详细信息，我们的服务为基础研究、药物开发和疾病治疗提供了宝贵的数据支持。
图1 RIME-MS实验流程[1]
3. RIME-MS特异性富集蛋白PPI互作网络图
雌激素受体α（ER）在大多数乳腺癌中是主导的转录因子，其相关蛋白质能影响药物反应，但直接识别相互作用蛋白质的方法一直受到限制。文章利用RIME-MS的方法纯化内源ER蛋白，并在乳腺癌细胞中发现了激动剂和拮抗剂结合条件下的相互作用组，揭示了乳腺癌中的转录网络。RIME-MS结果显示，富含雌激素的ER最主要的相互作用蛋白是GREB1，研究表明，GREB1是染色质结合的ER共激活因子，对于ER介导的转录至关重要，它稳定了ER与其他辅因子之间的相互作用。文章展示了异种移植瘤中的GREB1-ER相互作用，发现在一半的ER+原发性乳腺癌中存在GREB1-ER相互作用，并预示着良好的临床结局。这些发现揭示了GREB1作为一个雌激素特异性ER辅因子的重要作用，可作为乳腺癌对药物敏感的潜在生物标志物[2]。
图2 RIME实验证明乳腺癌中ER结合GREB1
参考文献
1.Mohammed, Hisham et al. “Rapid immunoprecipitation mass spectrometry of endogenous proteins (RIME) for analysis of chromatin complexes.” Nature protocols vol. 11,2 (2016): 316-26. doi:10.1038/nprot.2016.020.[ PMID: 26797456]
2.Mohammed, Hisham et al. “Endogenous purification reveals GREB1 as a key estrogen receptor regulatory factor.” Cell reports vol. 3,2 (2013): 342-9. doi:10.1016/j.celrep.2013.01.010. [PMID: 23403292]
