DMS(in vivo)rG4 -seq

  • 简介
  • 技术优势
  • 实验流程
  • 结果展示
  • DMS(in vivo)rG4测序是一种能在活细胞中精准定位和定量RNA G-四联体(rG4)结构的测序技术。该技术可有效检测内源rG4,揭示其在基因表达调控及疾病发生中的关键作用。

    rG4的动态结构转变可调控RNA转录、mRNA稳定性以及翻译。rG4还能与m7G、o8G和m6A等RNA修饰共同调控基因表达。rG4失调则会影响癌症、神经退行性疾病的发生发展。

    Aksomics提供的DMS(in vivo)rG4测序服务,结合体内DMS处理、BG4抗体富集及去甲基化处理,有效消除检测干扰,显著提升内源rG4定量分析的准确性与可靠性。

  • 1. 体内DMS处理与体外重折叠复现了真实的rG4结构

    2. 使用高亲和性的BG4抗体特异性富集含有rG4结构的RNA

    3. 采用Arraystar rtStar™ tRNA Pretreatment & First-Strand cDNA Synthesis Kit 进行去甲基化处理,去除了DMS 处理的副产物m1A/m3C所造成的检测干扰

    4. 物种适用范围广,结果信息丰富:兼容多种物种,能提供丰富的分析图表展示。

  • 1.体内 DMS 处理

    2.RNA 抽提与体外重折叠

    3.rG4 免疫沉淀

    4.去甲基化与反转录

    5.文库构建及测序

    6.数据分析

  • 1.rG4特异性富集peak的检出表


    2.rG4特异性富集peak的分布图

    sss's's's's


    3.rG4组间差异peak结果表


    4.rG4差异peak的火山图


    5.rG4差异peak所在基因的GO和pathway分析


    6.rG4 peak的可视化峰图