RNC联合 circRNA芯片-康成生物丨数谱生物

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RNC联合 circRNA芯片

简介
技术优势
实验原理和流程
结果展示

CircRNA是一类由特殊剪接机制形成的、具有闭合环状结构的非编码RNA。circRNA分子的组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征，使得circRNA在临床研究中具有明显的优势。

RNC（新生核糖体肽链复合物）分离是一种分离核糖体-RNA复合物的方法，由于RNA主要在翻译阶段与核糖体结合，因此根据核糖体-RNA复合物特有的沉降系数，通过离心的方法对其进行分离之后，便可以获得正在翻译的RNA信息。

通过RNC分离联合Arraystar CircRNA芯片可以准确鉴定具有翻译潜力的circRNA。circRNA翻译多肽与胃癌、结肠癌以及肌肉生成等多种疾病与生理过程的发生发展密切相关。

Molecular Cell：circRNA通过“显性负效应”调控母基因功能

ncRNA领域开拓者，美国医学科学院院士，斯坦福大学医学院著名教授Howard Y. Chang在《Molecular Cell》上发表重磅文章，揭示了circRNA翻译多肽, 通过“显性负效应”（dominant-negative effect）拮抗母基因功能的新机制。即circFGFR1翻译产生的多肽circFGFR1p导致FGFR1的功能受到抑制的现象。

图1. circFGFR1翻译产生的多肽circFGFR1p通过“显性负效应”抑制FGFR1的功能
1、取样方式简单便捷，细胞量可低至2*10^6；

2、高灵敏度检测与核糖体结合的circRNA分子：能准确鉴定与核糖体结合的circRNA，且不受开放阅读框长度和核糖体结合位点的影响；

3、保真性高的检测结果：直接离心特异性分离RNC组分，不易引入其他污染；

丰富的注释信息及SCI文章发表级别的图谱
RNC（Ribosome-nascent chain）分离联合Arraystar circRNA芯片服务通过细胞裂解后离心的方法，特异性分离出RNC组分，抽提RNA后获得与核糖体结合的具有翻译潜力的RNA分子。再经过高灵敏度性的Arraystar circRNA表达芯片，特异性检测与核糖体结合circRNA的情况，准确筛选出具有翻译潜力的circRNA信息。

circRNA_ID	Alias	test	control	Fold change	test( % Enrichment)	control( % Enrichment)	Diff % Enrichment
hsa_circRNA_002448	hsa_circ_0002448	-0.23669566	-0.93537523	1.62301864	47%	26%	21%
hsa_circRNA_402481		1.632452577	-0.33156857	3.901479032	79%	23%	56%

1、RNC结合circRNA的差异信息表格

chrom	strand	txStart	txEnd	circRNA_type	best_transcript	GeneSymbol
chr1	-	11133990	11137005	exonic	NM_001001998	EXOSC10
chr2	-	224629929	224642586	exonic	NR_110905	AP1S3

2、RNC结合circRNA的差异信息聚类图

3、深入数据分析：RNC结合circRNA的母基因mRNA GO/KEGG分析

参考文献：
[1] Tahmasebi S et. al. Nat Rev Mol Cell Biol. 2018. PMID: 30038383.

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