rG4 RIP-MS

  • 简介
  • 技术优势
  • 数据分析
  • 结果展示
  • rG4 RIP-MS 是一种用于系统性筛选和鉴定全转录组层面内源 rG4 结合蛋白(rG4BPs)的先进质谱技术。该技术利用特异性抗体富集与内源 rG4 结构结合的蛋白复合物,并通过高分辨率质谱(LC-MS/MS)实现全面高精度的蛋白质组学鉴定。

    rG4 结合蛋白(rG4BPs)通过精准识别 rG4 的独特结构,执行解旋、稳定、招募信号分子等关键功能,是决定 rG4 细胞内动态功能活性状态的核心要素。

    Aksomics 提供rG4 RIP-MS服务,创新性融合了结构特异性抗体(BG4)富集与高分辨率 LC-MS/MS 技术,能够全面、系统地捕捉专门针对 rG4 结构的相互作用蛋白,显著提升了 rG4BPs 鉴定的准确性与可靠性。

  • rG4 RIP-MS 在全基因组和蛋白质组水平上提供了一种独特的视角,其技术优势不仅体现在极高的构象特异性上,更在于其强大的科学发现潜力。

    1、针对 rG4 结合蛋白的特异性检测
    传统的 RNA 结合实验往往无法区分蛋白是结合在 RNA 的单链区域还是特定的二级结构上。rG4 RIP-MS 引入了 BG4 抗体特异性识别rG4结构,它对 G-四面体中心空腔具有极高的识别精度,确保了富集到的蛋白质复合物确实是与 rG4 结构物理结合。

    2、卓越的新靶点发现能力
    相比于基于序列预测的候选蛋白验证,rG4 RIP-MS 是一种“发现驱动型”技术。支持首次发现与疾病发展高度相关的新 rG4 结合蛋白,助力研究疾病发生新机制,这种科学洞察是传统的生信预测难以提供的。

    3、多维度质量控制保障数据可靠性
    rG4 RIP-MS服务通过计算 IP 与 IgG 对照的富集倍数(Fold Enrichment)以及计算独有肽段(Unique Peptides)的覆盖度,可以有效过滤掉高丰度背景蛋白(如某些核糖体支架蛋白或细胞骨架蛋白),确保具有高度生物学相关性的候选蛋白检出。

  • rG4 RIP-MS 的数据分析不仅仅是蛋白质名单的罗列,而是一个多步骤的、从原始信号到生物学解释的知识挖掘过程。
    1、蛋白质定性与定量分析
    2、差异富集分析与统计过滤
    3、rG4 结合蛋白的互作网络构建与功能分析

  • 1. rG4-RIP MS特异性富集的蛋白列表


    2. rG4-RIP MS特异性富集的蛋白火山图


    3. rG4-RIP MS特异性富集的蛋白GO/pathway分析


    4. rG4-RIP MS特异性富集的蛋白互作网络图


    样本需求:

    1.样品类型:

    细胞、组织样品,其它类型请详询。
    2.样品量:
    A)细胞 ≥ 2x10^7;
    B)组织 ≥ 200 mg;
    3.样品保存与运输:
    样品置于1.5 mL EP管中,细胞/组织液氮冻存;-80℃ 保存,避免反复冻融。干冰运输。