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单细胞测序技术服务 靶向单细胞测序（lncRNA&mRNA） 单细胞测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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NGS测序技术服务 R-loop 测序（DRIPc-seq） |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序（eccDNA测序） |
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Ribo-seq Ribo seq（ribosome profiling） |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC-seq |
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蛋白表达定量 Label free非标定量 TMT标记定量 PRM靶向定量 |
1、技术独特性：
RNase H酶切高效性：利用RNase H特异性切割“RNA-DNA”杂交链中的RNA链，释放此RNA链杂交区域的结合蛋白，反应具有高效性。
靶RNA区域选择性：可针对性研究目标转录本上某一特定区域的RNA互作蛋白。2、技术优势：
高特异性：通过设计特异性DNA探针，精准靶向目标RNA序列，释放并富集靶RNA区域的结合蛋白，有效避免非特异性结合蛋白的污染。
高灵敏度：与传统的RNA亲和捕获法相比，单次实验需要的起始细胞量减少。2.细胞裂解和相分离：
采用有机相分离技术在变性条件下裂解样本，可维持RNA-蛋白质复合物的完整性并实现有效回收。
3.靶RNA降解：采用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）进行蛋白质组学分析，鉴定RBPs。
图 2 TREX实验流程
1.质谱检测结果
2.差异蛋白GO分析
3.差异蛋白KEGG pathway分析
4.String蛋白质互作网络分析
NORAD是一种长度为5.3 kb的长链非编码RNA，在大多数人体组织和细胞中呈现高表达[1]。研究表明，NORAD在DNA损伤条件下表达显著上调，其主要生物学功能是维持基因组稳定性[2]。NORAD包含5个重复区域（ND1-ND5），其中ND4区域呈现高度保守性，然而其直接互作蛋白尚未完全阐明。研究人员采用TREX-MS技术，采用9条反义寡核苷酸探针对ND4区域进行全覆盖杂交，成功鉴定出360个相互作用蛋白，包括已知的PUM1蛋白以及新型相互作用因子RBMX、TOP1等[3]。
