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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
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产品列表
| 芯片名称 | 货号 | 规格 | 描述 |
|---|---|---|---|
| NuRNA™ Human Small RNAs Biogenesis-Related Protein PCR Array | AS-NM-002-1 | 384-well (2*192) / plate | miRNAs（57个）+piRNAs（17个） +siRNAs（24个）+snoRNAs（24个） +snRNAs（41个）+tRNAs/tRFs（47个） |
| NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480) | AS-NM-002-1 | 384-well (2*192) / plate |
产品特点
•覆盖度广—收集了GO通路中所有与small RNA合成相关的蛋白分子
•严谨性强—所有引物都通过了多样本严格验证
•快速简易—即用型384孔板规格，只需将cDNA与qPCR Master Mix混合试剂加入PCR板中，4小时内得到实验结果。cDNA无需预先扩增。
为保证NuRNA™ Small RNAs Biogenesis-Related Protein PCR 芯片的实验效果，建议配套使用Arraystar rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (AS-FS-001) 和 Arraystar SYBR® Green Real-time qPCR Master Mix
Small RNA是指长度小于200bp，不具蛋白编码能力的一类RNA分子。small RNAs不仅在细胞中具有较高的表达量，也广泛存在于各类体液中。根据长度、结构形态、功能形式以及合成途径的不同，科研人员将small RNAs分成了七种类型：microRNA (miRNA)、PIWI-interacting RNA (piRNA)、small interfering RNA (siRNA）、small nucleolar RNA (snoRNA）、small nuclear RNA (snRNA)、transfer RNA (tRNA）、tRNA-derived fragment (tRF&tiRNA)（图1）。这些small RNA分子在转录水平或转录后水平，参与调控基因表达[1-3]。
small RNA的合成途径极其复杂，具体过程有待进一步的挖掘。在许多疾病中，科研人员都检测到了不同small RNA的合成紊乱。例如，DROSHA与DICER1是miRNA合成过程中非常关键的两个蛋白，其表达水平会随着肿瘤的发生发展而变化，并可作为神经母细胞瘤预后诊断的潜在标记物[4]。近些年来，small RNA吸引了越来越多的关注，small RNA合成途径的研究也受到了更多的重视。
对于特定通路或聚焦领域中的基因而言，PCR芯片是其表达研究可靠便捷的手段。为了帮助研究人员方便快捷地分析small RNA合成相关蛋白的表达水平，Arraystar开发了small RNA合成蛋白检测PCR芯片。该芯片能够同时分析185个mRNA，它们都是在各类small RNAs合成过程中发挥关键作用的蛋白分子的表达水平，是small RNAs研究的一件利器。
图 1. Small RNAs的分类与功能
参考文献
[1] Kim VN. Small RNAs: classification, biogenesis, and function. Mol cells 19, 1-15. (2005),
[2] Esteller M. Non-coding RNAs in human disease. Nat Rev Genet 12, 861-74. (2011), PMID:22094949.
[3] Matera AG, et al. Non-coding RNAs: lessons from the small nuclear and small nucleolar RNAs. Nat Rev Mol Cell Biol 8, 209-20. (2007), PMID:17318225.
[4] Lin RJ, et al. microRNA signature and expression of Dicer and Drosha can predict prognosis and delineate risk groups in neuroblastoma. Cancer Res 70, 7841-50. (2010), PMID:20805302.
表1.人类small RNAs合成相关蛋白（185个蛋白）
适用的PCR仪
ABI ViiA™ 7
ABI 7500 & ABI 7500 FAST
ABI 7900HT
ABI QuantStudio™ 6 Flex Real-Time PCR system
ABI QuantStudio™ 7 Flex Real-Time PCR system
ABI QuantStudio™ 12K Flex Real-Time PCR System
Bio-Rad CFX384
Bio-Rad iCycler & iQ Real-Time PCR Systems
Eppendorf Realplex
QIAGEN Rotor Gene Q 100
Roche Light Cycler 480
Stratagene Mx3000
Roche Light Cycler 480
Aksomics使用Arraystar的芯片为客户提供服务，以下为相关资料:
产品说明书：
Manual_NuRNA™_Human_Small_RNA_Biogenesis_Protein_PCR_Array_v1.02
分析工具： 
Analysis Tool for NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array_v1.0
