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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
第二军医大学孙树汉教授课题组使用Arraystar Human LncRNA芯片研究肝癌，连续发表了两篇Hepatology文章；近期，其课题组的研究成员应用Arraystar Mouse LncRNA芯片，发现了能抑制肝癌转移的新LncRNA——Dreh，该研究成果刊登在国际著名肝病研究杂志Hepatology上。 （芯片实验均由康成提供技术服务）
研究背景
乙型病毒性肝炎是华人人群中肝癌的首要因素。乙肝病毒表达的HBx蛋白能促进肝脏肿瘤的形成，但其分子机制仍不清楚。孙树汉教授课题组本次研究目的在于揭示HBx和热点分子——非编码RNA之间的关联。
研究思路
应用美国Arraystar公司Mouse LncRNA V2.0芯片，研究人员分别对6只HBx转基因小鼠和对照组小鼠肝脏的LncRNA表达谱进行研究，筛选出差异表达的长链非编码RNA，其中LncRNA.Dreh(AK050349)表达量在所有年龄和性别的转基因小鼠中都显著下调，因此研究者将目标锁定在该分子上。
研究者对LncRNA.Dreh进行深入的功能分析，发现其能抑制细胞的增殖和迁移；进一步的研究发现LncRNA.Dreh抑癌作用背后的分子机制：它能结合中间丝蛋白并抑制其表达，通过改变细胞骨架结构和形态，阻止癌细胞的转移。
由于LncRNA.Dreh的保守性很高，在对50例临床样本(肝癌组织v.s.癌旁组织)的研究中发现：该分子在癌组织中表达量比正常组织低，并且和病人的预后相关；LncRNA.Dreh表达量高的病人复发率低并且生存期长。
研究意义
该研究将乙肝病毒自身表达的HBx蛋白和肝脏组织中的LncRNA关联起来。发现了LncRNA对细胞骨架结构的调控作用，由此来抑制癌细胞的转移。找到了新的肝癌预后标志物，其研究有着重大的临床意义。
原文出处
HBx-related lncRNA Dreh inhibits hepatocellular carcinoma metastasis by targeting the intermediate filament protein vimentin. Hepatology. 2012.
