m7G tRNA单碱基测序（m7G-Quant-Seq）

● 区分帽子与内部位点：靶向化学转化把内部 m⁷G 与 5' 帽子结构区分开

● 成熟 tRNA 位点级定量：每个内部 m⁷G 位点的逆转录特征换算为修饰水平

● 无抗体读出：回避抗体对 tRNA 紧密结构的捕获偏倚

● 结构域解析：m⁷G 对 tRNA 折叠与解码的影响可在位点层面追踪

● tRNA 专属注释：每个位点给出成熟 tRNA 相对坐标、基因归属、反密码子、isoacceptor 与结构域信息

● 已知位点覆盖：可变环等位置的经典 m⁷G 位点与新型位点一并报告

在 tRNA 中，该修饰稳定 L 形折叠结构并精细调控反密码子–密码子解码，因此成熟环与反密码子区域的单碱基定位尤为关键。靶向化学转化可区分内部 N7-甲基鸟苷与 5' 帽子结构，将每个内部 m7G 位点记录为独特的逆转录特征，实现单碱基分辨率的定量。这套不依赖抗体的读出方式可在单碱基水平定位每个 m7G 位点。

关键概念：m7G tRNA单碱基测序（m7G-Quant-Seq）是一种单碱基分辨率方法，靶向化学转化可区分内部 N7-甲基鸟苷与 5' 帽子结构，在单碱基分辨率上检测并定量内部 m7G。

图 1. m7G-Quant-seq m⁷G 检测原理。

图 2. m7G-Quant-seq 实验流程。

下游分析将 reads 比对到精选的参考序列，判定转化特征，并报告每个位点的内部 m7G 化学计量，同时提供 motif、分布、差异、富集与基因组浏览器结果。

交付内容

• 原始 m⁷G tRNA 测序 FASTQ 数据文件，可直接提交至 GEO/SRA 等公共数据库。

• 含 BAM 比对文件与关键比对指标的质控报告。

• 高置信度单碱基 m⁷G tRNA 位点表（XLSX），含坐标、反密码子、isoacceptors 与化学计量。

• 单碱基 m⁷G 在 tRNA 各结构域的分布图与一致性 m⁷G motif 分析图（PDF/PNG）。

• 单碱基分辨率 m⁷G tRNA 差异位点表（XLSX），含倍数变化等统计信息。

• 兼容基因组浏览器的 m⁷G 信号可视化文件（bigWig/bedGraph）及结构化 tRNA 报告。

• 化学计量比较：在不同条件或疾病状态下比较位点级 m⁷G 水平

• 结构–功能关联：把 m⁷G 与 tRNA 稳定性、折叠状态关联

• 翻译保真度：将 m⁷G 变化与解码准确性、翻译效率联系起来

• isoacceptor 比较：比较不同 isoacceptors 与 isodecoders 的 m⁷G 模式

• 疾病相关：筛选疾病相关的 tRNA m⁷G 位点

tRNA 上有哪些特征会被注释？

每个位点都会定位到成熟 tRNA 转录本，并给出相对坐标、tRNA 基因归属、反密码子、isoacceptors 与结构域信息，方便您结合 isoacceptors 和结构域来解读位点。

该方法能否在单碱基分辨率上测量修饰？

可以。靶向化学转化可区分内部 N7-甲基鸟苷与 5' 帽子结构，将每个内部 m7G 位点记录为独特的逆转录特征，在单碱基分辨率上给出定量结果，并给出 tRNA 中每个位点的定量结果；反应无需抗体且可重复。

该方法与基于抗体的 tRNA 分析有何不同？

抗体法依赖富集，分辨率有限，也容易带入固有的 motif 偏好。我们的方法不使用抗体，直接在 tRNA 上给出单碱基分辨率的定量结果，避开交叉反应与富集偏倚。

这项服务如何支持 m7G 修饰研究？

我们会在单碱基分辨率上分析 m7G，帮您探索它在 RNA 功能与调控中的作用，为后续研究提供证据基础。

高分辨率 m7G 检测有何价值？

准确的 m7G 图谱能增强研究结论的证据力，让后续研究更扎实。

[1] m7G-quant-seq: Quantitative Detection of RNA Internal N7-Methylguanosine. ACS Chemical Biology 2022;17(12). DOI: 10.1021/acschembio.2c00792. PMID: 36398936.