服务优势
● 还原型转化读出：RedaC-T 化学把乙酰化胞苷转成可判读特征，与未修饰胞苷区分，全程不依赖抗体
● 成熟 tRNA 位点级定量：转化信号直接换算为每个 ac⁴C 位点的修饰比例，跨样本可比
● 无抗体读出：回避免疫沉淀对 tRNA 紧密三级结构的捕获偏倚与交叉反应
● 结构域解析：ac⁴C 对 L 形折叠与反密码子–密码子解码的调控可在位点层面追踪
● tRNA 专属注释：每个位点给出成熟 tRNA 相对坐标、tRNA 基因归属、反密码子、isoacceptor 与结构域信息
● isoacceptor 分辨率：可在不同 isoacceptors 与 isodecoders 之间比较同一位置的修饰状态
背景介绍
在 tRNA 中，该修饰稳定 L 形折叠结构并精细调控反密码子–密码子解码，因此成熟环与反密码子区域的单碱基定位尤为关键。还原型 RedaC-T 转化选择性作用于乙酰化胞苷并将其记录为可读特征，同时区分未修饰胞苷，从而在单碱基分辨率上定位每个 ac4C 位点。这套不依赖抗体的读出方式可在单碱基水平定位每个 ac4C 位点。
关键概念：RedaC-T-seq 在单碱基分辨率上定位 tRNA 中的 ac4C。该方法通过还原型转化将乙酰化胞苷标记为可读特征并与未修饰胞苷区分；由于无需抗体，其读出可在 tRNA 转录组范围提供定量的 ac4C 修饰图谱。
图 1. RedaC-T-seq ac⁴C 检测原理。
实验流程
图 2. RedaC-T-seq 实验流程。
生物信息分析
下游分析将 reads 比对到精选的 tRNA 参考序列，识别 RedaC-T 转化特征，并报告每个位点的 ac4C 化学计量；流程同时提供 motif 分析、差异修饰检验与基因组浏览器可视化文件。
交付内容
• 原始 ac⁴C tRNA 测序 FASTQ 数据文件，可直接提交至 GEO/SRA 等公共数据库。
• 含 BAM 比对文件与关键比对指标的质控报告。
• 高置信度单碱基 ac⁴C tRNA 位点表（XLSX），含坐标、反密码子、isoacceptors 与化学计量。
• 单碱基 ac⁴C 在 tRNA 各结构域的分布图与一致性 ac⁴C motif 分析图（PDF/PNG）。
• 单碱基分辨率 ac⁴C tRNA 差异位点表（XLSX），含倍数变化等统计信息。
• 兼容基因组浏览器的 ac⁴C 信号可视化文件（bigWig/bedGraph）及结构化 tRNA 报告。
研究应用
• 解码保真度：在反密码子与摆动位点区域定位 ac⁴C，评估其对密码子识别的贡献
• 氨酰化与翻译：把位点级修饰水平与 tRNA 氨酰化状态、翻译效率关联
• 结构生物学：在 D 环、反密码子环、TΨC 环与氨基酸接受臂内解析修饰分布
• isoacceptor 比较：比较不同 isoacceptors 与 isodecoders 在相同位置的修饰差异
• 疾病相关：筛选应激或疾病状态下差异修饰的 tRNA 位点作为候选标志物
常见问题
tRNA 上有哪些特征会被注释？
每个位点都会定位到成熟 tRNA 转录本，并给出相对坐标、tRNA 基因归属、反密码子、isoacceptors 与结构域信息，方便您结合 isoacceptors 和结构域来解读位点。
RedaC-T-seq 能否在单碱基分辨率上测量 ac4C？
可以。还原型 RedaC-T 转化选择性作用于乙酰化胞苷并将其记录为可读特征，同时区分未修饰胞苷，从而在单碱基分辨率上定位每个 ac4C 位点，并给出 tRNA 中每个位点的定量结果。
该方法与基于抗体的 tRNA 分析有何不同？
抗体法依赖富集，分辨率有限，也容易带入固有的 motif 偏好。我们的方法不使用抗体，直接在 tRNA 上给出单碱基分辨率的定量结果，避开交叉反应与富集偏倚。
ac4C 分析的研究价值是什么？
我们会在 tRNA 上以单碱基分辨率报告 ac4C，帮您研究它的结构与解码作用，让结论更站得住脚。
单碱基 ac4C 检测为何重要？
准确、定量的 tRNA ac4C 信号能为转化研究提供可靠结论，为 RNA 生物学研究提供有力支撑。
参考文献
[1] Arango D, Sturgill D, Yang R, et al. Oberdoerffer S. Direct epitranscriptomic regulation of mammalian translation initiation through N4-acetylcytidine. Molecular Cell 2022;82(15):2797-2814.e11. DOI: 10.1016/j.molcel.2022.05.016