服务优势
● 还原型转化读出：RedaC-T 化学把乙酰化胞苷转成可判读特征，与未修饰胞苷明确区分，无需亚硫酸氢盐那样的强酸条件
● 位点级绝对定量：转化信号直接换算为每个 ac⁴C 位点的修饰比例，而不是区域富集强度
● 无抗体读出：不依赖 ac⁴C 抗体，回避免疫沉淀的交叉反应、批间波动与 motif 偏好
● 修饰与功能直连：ac⁴C 与转录本稳定性、翻译效率及基因调控的关系可在位点层面解析
● 转录本注释完备：每个位点给出基因组坐标、宿主基因，以及编码区与非翻译区的功能区域归属
背景介绍
在 mRNA 中，该修饰影响转录本稳定性、翻译与基因调控，因此跨编码区与非翻译区的单碱基定位尤为关键。还原型 RedaC-T 转化选择性作用于乙酰化胞苷，将其记录为可读特征并区分未修饰胞苷，从而在单碱基分辨率上定位每个 ac4C 位点。这套不依赖抗体的读出方式可在单碱基水平定位每个 ac4C 位点。同一流程可扩展至长链非编码 RNA（lncRNA），让研究者可以在同一次实验里并行分析 mRNA 与 lncRNA 上的该修饰。
关键概念：ac4C RNA单碱基测序（RedaC:T-seq）是一种单碱基分辨率测序方法，还原型 RedaC-T 转化选择性作用于乙酰化胞苷并将其记录为可读特征，同时区分未修饰胞苷，从而在单碱基分辨率上定位每个 ac4C 位点；这套不依赖抗体的读出方式可在蛋白编码转录本范围内提供定量、单碱基的修饰图谱。
图 1. RedaC-T-seq ac4C 检测原理。
实验流程
图 2. RedaC-T-seq 实验流程。
生物信息分析
生物信息分析流程将 reads 比对到参考转录组，识别 RedaC-T 转化特征，并在单碱基分辨率上定量 ac4C 化学计量。分析内容包括 motif 特征、差异修饰、功能富集与基因组浏览器可视化。
交付内容
• 原始 ac⁴C mRNA 测序 FASTQ 数据文件，可直接提交至 GEO/SRA 等公共数据库。
• 样本与测序质控报告，含排序后的 BAM 比对文件及核心比对统计。
• 高置信度单碱基 ac⁴C 位点注释表（XLSX），含坐标、基因与定量结果。
• 单碱基 ac⁴C 转录本特征分布图与一致性 ac⁴C motif 分析图（PDF/PNG）。
• 单碱基分辨率 ac⁴C 差异甲基化分析表（XLSX），含倍数变化等统计信息。
• ac⁴C 修饰基因的功能富集分析报告（HTML/PDF/PNG）。
• 兼容基因组浏览器的可视化文件（bigWig/bedGraph）及完整的 ac⁴C 分析项目报告。
研究应用
• 转录组范围定位：在 mRNA 与 lncRNA 上系统绘制 ac⁴C 位点图谱，建立修饰基线
• 翻译与稳定性：把位点级 ac⁴C 水平与转录本翻译效率、半衰期变化关联
• 编码区与 UTR：比较 CDS、5'/3' UTR 及剪接邻近区域的修饰分布差异
• 疾病标志物：在疾病与对照之间筛选差异修饰位点，缩小候选验证范围
常见问题
mRNA 上有哪些特征会被注释？
每个位点都会注释到参考转录组，并给出基因组坐标、宿主基因与功能区域，方便您把位点和基因功能放在一起解读。
该方法能否在单碱基分辨率上定量修饰？
可以。还原型 RedaC-T 转化选择性作用于乙酰化胞苷并将其记录为可读特征，同时区分未修饰胞苷，从而在单碱基分辨率上定位每个 ac4C 位点，并在 mRNA 中给出每个位点的定量结果。
该方法与基于抗体的 mRNA 分析有何不同？
抗体法依赖富集，分辨率有限，也容易带入固有的 motif 偏好。我们的方法不使用抗体，直接在 mRNA 上给出单碱基分辨率的定量结果，既避开了交叉反应与富集偏倚，也方便和正交方法互相验证；如果您的课题需要的是位点级定量而不是区域级富集，会很合适。
这项服务如何支持 ac4C 生物学研究？
我们会在单碱基分辨率上解析 ac4C，帮您考察它在基因表达、翻译与疾病中的调控作用，为后续机制研究打好基础。
高分辨率 ac4C 检测有何价值？
精确、定量的 ac4C 图谱是可靠结论的基础，能让您对 RNA 调控及其生物学后果的判断更有把握。
这项服务是否也覆盖 lncRNA？
是的，我们提供mRNA修饰和mRNA 与长链非编码 RNA（lncRNA）修饰两类服务供选择。两类转录本可以在同一次实验里一起分析，您不必拆成两个项目，研究范围也随之打开。
参考文献
[1] Arango D, Sturgill D, Yang R, et al. Oberdoerffer S. Direct epitranscriptomic regulation of mammalian translation initiation through N4-acetylcytidine. Molecular Cell 2022;82(15):2797-2814.e11. DOI: 10.1016/j.molcel.2022.05.016