01为什么选择数谱生物
RNA 修饰检测按颗粒度分为三条技术路线,同一份样本可以按研究问题组合使用。
单碱基定位与定量
- 12 条单碱基方法,覆盖 m6A、m5C、ac4C、m7G、Ψ、m1A、m3C、O8G、D 与 Nm
- 位点位置与修饰比例从同一份信号读出,可跨样本比较
- 位点表带坐标与宿主基因,便于后续整理与使用,也便于与转录组、芯片结果对齐
02四条服务线
按研究目的分:要位点和比例走单碱基测序;要先在大样本里看整体丰度变化走 RIP 富集;要在队列里做批量筛选走芯片;GlycoRNA 走独立的整体检测路线。
01 / SINGLE BASE
单碱基修饰测序
在成熟 RNA 上逐位点读出修饰类型与修饰比例,是修饰定位与定量的主线方案,覆盖 10 类以上修饰: m6A、m5C、ac4C、m7G、Ψ、m1A、 m3C、O8G、D 与 Nm。
查看单碱基服务 →04 / GLYCORNA
GlycoRNA 解决方案
糖基化 RNA 的检测方案:芯片筛选、测序与整体检测三条路线 —— GlycoRNA 芯片 · GlycoRNA 测序 · GlycoRNA 整体检测。
03按研究场景选修饰
不同研究场景通常对应不同的修饰。下表把常被问到的场景映射到“值得先从哪个修饰入手”,以及对应的解决方案页。
| 研究场景 | 建议先看的修饰 | 对应的解决方案 |
|---|---|---|
| 肿瘤与代谢 | m6Aac4Cm5C | 标志物发现 m6A 与转录本命运 |
| R-loop 与 G-四链体生物学 | m6Am5C | m5C 与 DNA 损伤应答 |
| 生物分子凝聚体 | m7Gm6A | m7G、翻译与凝聚体 |
| 经典翻译调控 | m6Am5Cm7Gac4Cm1A | 翻译调控 ac4C 与 m1A |
| 翻译异常与 tRNA 相关研究 | ΨA-to-I(肌苷) | 假尿嘧啶与翻译 A-to-I 编辑 |
| 氧化应激与 ROS | O8G | 氧化性 RNA 损伤 应激与疾病模型 |
| 早期探索 | 2'-O-Me(mRNA / lncRNA)2'-O-Me(rRNA)m3CD | 新兴修饰 修饰图谱绘制 |
04单碱基修饰测序服务
每条服务都按同一套结构给出:服务优势、背景与检测原理、实验流程、生物信息分析、研究应用、常见问题与参考文献。点方法名可以进入详细说明。
05解决方案
按研究问题进入:同一个修饰在不同研究场景下的读数、路线与旁证并不相同。下面几页各对应一类常见问题,写明这一类问题该怎么读、结论能落到哪一层。
07技术文章 · 研究前沿
方法原理、路线之间的取舍、能力边界与研究设计取舍 —— 把「为什么这么选」写清楚的一组文章,按方法线与生物学线分开。
08关于数谱生物
二十余年 · 表观转录组与 RNA 修饰研究
数谱生物以表观转录组学与 RNA 修饰为核心技术方向,在 RNA 修饰方向形成了从样本处理、文库构建、测序到生物信息分析的完整流程 —— 覆盖位点级修饰图谱、区段富集与芯片筛选三个层面,并配有定量 PCR 与质谱等验证手段;公司平台同时覆盖其它组学方向。
总部位于上海,并在国内多地设有办事处,是 ISO9001 质量管理体系认证单位。团队与国内多家科研院所、医疗机构保持长期合作,帮助客户把 RNA 修饰层面的检测结果用在肿瘤、免疫、神经与代谢等方向的研究中。
- 200+RNA 修饰优质 SCI 数量
- 3200+客户发文数量
- 17200+文章影响因子总和
- 5000+长期合作伙伴