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RNA 修饰检测服务 · 单碱基分辨率定位与定量 服务总览 免费热线 400-886-5058

PUBLISHED WITH AKSOMICS

客户已发表的研究

客户成果持续发表于 Molecular Cancer、Circulation Research、Nature Communications 等国际期刊, 覆盖 m6A、m1A、m7G、o8G 等修饰。 检测路线包括 MeRIP-seq、表观转录组芯片与 small RNA 修饰芯片。

使用数谱 RNA 修饰检测服务发表的客户论文

AKSOMICS / RNA MODIFICATION

把 RNA 修饰从“有没有”
读到“在哪个位点、有多少”

数谱生物提供 RNA 修饰检测服务:在单碱基分辨率上给出修饰位点与修饰比例, 覆盖 m6A、m5C、ac4C、m7G、Ψ、m1A、 m3C、O8G、D 与 Nm 等修饰类型,用于修饰与稳定性、翻译效率、 writer / eraser / reader 调控机制的研究。

  • 单碱基分辨率
  • 位点级修饰比例
  • 多修饰联合读数
  • GlycoRNA 整体检测
CAM-seq 检测 m6A 的原理示意

01为什么选择数谱生物

RNA 修饰检测按颗粒度分为三条技术路线,同一份样本可以按研究问题组合使用。

同一份样本,多条路线

数谱生物在 RNA 修饰与表观转录组方向积累多年:位点级定位与定量、区段富集与芯片筛选、糖基化 RNA 三条线按问题切换,同一份样本可完成多项分析。

了解我们的协作方式 →

单碱基定位与定量

  • 12 条单碱基方法,覆盖 m6A、m5C、ac4C、m7G、Ψ、m1A、m3C、O8G、D 与 Nm
  • 位点位置与修饰比例从同一份信号读出,可跨样本比较
  • 位点表带坐标与宿主基因,便于后续整理与使用,也便于与转录组、芯片结果对齐
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富集与芯片筛选

  • 9 条富集路线报告区段富集,适合大样本初筛
  • 筛出的候选回到单碱基路线定到具体位点
  • 分组之间可对比:处理、时间点或不同队列放在同一批目标上并排比较
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GlycoRNA

  • 糖基化 RNA 的检测分芯片、测序与整体检测三条路线
  • 按糖基读出:检测跟着 RNA 上的糖走,不依赖碱基转化
  • 用于糖基化水平与分子大小分布的评估
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02四条服务线

按研究目的分:要位点和比例走单碱基测序;要先在大样本里看整体丰度变化走 RIP 富集;要在队列里做批量筛选走芯片;GlycoRNA 走独立的整体检测路线。

RNA 修饰检测是在 RNA 分子上定位化学修饰、并给出修饰比例的一类分析。单碱基路线通过化学转化或酶学处理,把修饰位点转成可读的测序信号; 富集路线用抗体把含修饰的片段拉下来做测序;芯片路线用末端标记定量,在面板覆盖的范围内给出修饰水平,适合在队列里并排比较多个分组。

01 / SINGLE BASE

单碱基修饰测序

在成熟 RNA 上逐位点读出修饰类型与修饰比例,是修饰定位与定量的主线方案,覆盖 10 类以上修饰: m6A、m5C、ac4C、m7G、Ψ、m1A、 m3C、O8G、D 与 Nm。

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02 / RIP

RNA 修饰 RIP 测序

抗体富集路线,用较低的测序量评估修饰的整体丰度变化,适合大样本初筛与分组比较。

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03 / ARRAY

RNA 修饰芯片

按修饰类型分流:每个项目选一种修饰类型,面板覆盖的分子类型一次上机读出修饰水平,适合在队列里批量筛选后再用单碱基路线定到具体位点。

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04 / GLYCORNA

GlycoRNA 解决方案

糖基化 RNA 的检测方案:芯片筛选、测序与整体检测三条路线 —— GlycoRNA 芯片 · GlycoRNA 测序 · GlycoRNA 整体检测。

03按研究场景选修饰

不同研究场景通常对应不同的修饰。下表把常被问到的场景映射到“值得先从哪个修饰入手”,以及对应的解决方案页。

BY MODIFICATION按修饰看方案

一个修饰一页:这个修饰读什么、走哪条路线读、通常还要搭配哪些读数。

BY QUESTION按研究问题看方案

修饰图谱、writer / eraser / reader、标志物筛选、应激响应、翻译调控与 GlycoRNA 线。

BY DESIGN修饰图谱绘制

先回答哪些转录本带修饰,再回答修饰落在转录本的哪个位置。

04单碱基修饰测序服务

每条服务都按同一套结构给出:服务优势、背景与检测原理、实验流程、生物信息分析、研究应用、常见问题与参考文献。点方法名可以进入详细说明。

m6A

CAM-seq

近中性协同催化,位点单碱基定位与位点级定量。

m5C

BS-seq

无抗体亚硫酸氢盐法,m5C 单碱基定位与定量。

m1A

m1A-Quant-seq

读通型逆转录给出位点级 m1A 百分比。

ac4C

RedaC:T-seq

无抗体还原型转化法,定位 ac4C 位点。

m7G

m7G-Quant-Seq

KBH4 还原与温和脱嘌呤,定量 tRNA m7G46,并以 18S rRNA 位点做方法验证。

m3C

HAC-seq

肼-苯胺切割实现 m3C 单碱基定位。

m3C

m3C-IP-seq

抗体富集提升弱修饰位点检出,与化学法互验。

Ψ

BID-seq

Ψ 缺失特征单碱基定位,低假阳性判读。

Ψ & I

Ψ & Inosine

一次实验同时定位 Ψ 与肌苷。

2'-O-Me

NM-seq

高碘酸盐 OED 循环,读出核糖甲基化位点。

D

CRACI-seq

化学转化产生独特逆转录特征,定位二氢尿苷。

O8G

O8G-miSeq

抗体富集结合 G>T 突变读出,定位氧化修饰。

查看全部单碱基服务(12 条方法)→

05解决方案

按研究问题进入:同一个修饰在不同研究场景下的读数、路线与旁证并不相同。下面几页各对应一类常见问题,写明这一类问题该怎么读、结论能落到哪一层。

SOLUTION

m6A 与转录本命运

位点级 m6A 与剪接、出核、翻译、稳定性读数对齐在同一批样本上。

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SOLUTION

修饰图谱绘制

同时回答哪些转录本带修饰、修饰落在哪个位置,得到的是位点级图谱。

查看方案 →

SOLUTION

writer / eraser / reader 研究

扰动修饰酶后比较同一批位点的修饰变化,差异就是这个酶留下的足迹。

查看方案 →

SOLUTION

标志物发现

先在队列里覆盖整批样本,再收窄到能把两组分开的候选位点。

查看方案 →

SOLUTION

翻译调控

把已定位的修饰与稳定性、翻译效率接起来,看条件变化时两者怎么一起变。

查看方案 →

SOLUTION

应激与疾病模型

比较同一批位点在条件、分期或基因型之间的变化,两侧在同一项目里读出。

查看方案 →

查看全部解决方案(17 个方向)→

06资源与客户成果

方法选择的取舍、各条路线的能力边界、以及客户已发表的研究,都在这里。

REVIEWS

技术文章

方法原理、能力边界与研究设计取舍,按方法线与生物学线分类。

PUBLICATIONS

客户成果

使用数谱生物 RNA 修饰检测服务的已发表研究。

PRODUCTS

配套产品

修饰检测 PCR 芯片、试剂盒与引物套装。

FAQ

常见问题

关于修饰检测的常见研究性问题。

MOD TYPES

修饰类型总览

一页看清各类修饰的化学身份、生物学角色与可用的检测路线。

07技术文章 · 研究前沿

方法原理、路线之间的取舍、能力边界与研究设计取舍 —— 把「为什么这么选」写清楚的一组文章,按方法线与生物学线分开。

REVIEW

怎么选修饰检测方法

单碱基测序、富集测序与芯片各自回答不同的问题,选错不是精度不够。

REVIEW

m6A 的两条读法

一条落到碱基给出比例,一条先说清哪些转录本与区段上有修饰。

REVIEW

怎么读修饰比例

比例来自两种读出的比值,不是富集强度,也不是表达量。

REVIEW

修饰怎么影响转录本的命运

剪接、出核、翻译效率与稳定性四个层级,能说到哪层取决于读数选到哪层。

REVIEW

GlycoRNA 入门

读的是糖链而不是碱基,所以检测思路走的是另一条线。

REVIEW

测序结果之外,LC-MS 补了什么

一类报告位置,另一类报告样品里化学上有什么,两者放在一起读。

查看全部技术文章 →

08关于数谱生物

二十余年 · 表观转录组与 RNA 修饰研究

数谱生物以表观转录组学与 RNA 修饰为核心技术方向,在 RNA 修饰方向形成了从样本处理、文库构建、测序到生物信息分析的完整流程 —— 覆盖位点级修饰图谱、区段富集与芯片筛选三个层面,并配有定量 PCR 与质谱等验证手段;公司平台同时覆盖其它组学方向。

总部位于上海,并在国内多地设有办事处,是 ISO9001 质量管理体系认证单位。团队与国内多家科研院所、医疗机构保持长期合作,帮助客户把 RNA 修饰层面的检测结果用在肿瘤、免疫、神经与代谢等方向的研究中。

  • 200+RNA 修饰优质 SCI 数量
  • 3200+客户发文数量
  • 17200+文章影响因子总和
  • 5000+长期合作伙伴

不确定该从哪条路线入手?

把样本类型、物种与研究问题发给我们,我们按你的问题给出可执行的检测组合建议。