Small RNA修饰——2021研究热点,大有可为

Small RNA分子上存在着多种不同的修饰,如5-甲基胞嘧啶(m5C),7-甲基鸟嘌呤(m7G),8-氧代鸟嘌呤(O8G),假尿嘧啶(Ψ)和N6-甲基腺嘌呤(m6A)等。已有研究表明,Small RNA上的修饰可以影响miRNA生成、miRNA识别靶基因和Small RNA的稳定性等,也可作为区分自身和外源RNA的标记,同时还具有优良的诊断疾病与判断患者预后的潜力,有望成为一类新的生物标志物。


Nature重磅发布:Small RNA修饰在疾病发生中的重要作用

miR-1特异性位点的O8G修饰诱导心肌肥大

肾上腺素受体在受到激活后会产生ROS(活性氧)并导致miR-1 种子区(位置2-8)的O8G修饰,该修饰改变了原本G与C的配对,变为与腺嘌呤(A)配对,导致了miR-1靶向的mRNA发生变化,最终诱导产生心肌肥大。该研究揭示了miRNA上特定位点的o8G修饰作为表观转录修饰扮演着重要的基因调控作用。



Seok, Heeyoung, et al. "Position-specific oxidation of miR-1 encodes cardiac hypertrophy." Nature 584.7820 (2020): 279-285.


Arraystar Small RNA修饰芯片新品发布!

Arraystar Small RNA修饰芯片可在单次实验中同时定量miRNA,pre-miRNA和tRNA衍生的small RNA(tsRNA,包括tRF&tiRNA)的一种碱基修饰。可检测的修饰包括:8-氧代鸟嘌呤(o8G),7-甲基鸟嘌呤(m7G),N6-甲基腺嘌呤(m6A),假尿嘧啶(Ψ)和5-甲基胞嘧啶(m5C)。


Arraystar small RNA修饰芯片优势

• 金标准准确定量small RNA的修饰:直接RNA末端标记,避免了测序建库过程中因修饰导致的cDNA延伸中止的情况,可确保对small RNA修饰定量的高保真性。

• 高灵敏度检测低水平small RNA的修饰: 克服二代测序的局限性,对低表达或低修饰水平的small RNA分析具有出色的分析灵敏度。

• 所需样品量少,总RNA量可低至1 µg。


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