tRNA 与 tRF&tiRNA 研究相关服务
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客户发表成果

客户成果:从 tRNA 检测到高水平论文

数谱生物 tRNA 检测平台已成功助力数十个课题组在 Nature Cancer、Nature Communications、 Nature Cell Biology、Molecular Cancer、Circulation Research 等国际期刊发表高水平研究成果。

  • Nature / Cell 系列
  • 高分客户文章
  • 全套数据验证
  • 多学科应用
客户发表成果:Molecular Cancer、Nature Cancer、Journal of Hepatology、Nature Cell Biology、Circulation Research、Nature Communications 六篇论文的官方页面
结直肠癌 · 肝内胆管癌 · 黑色素瘤 · 肺动脉高压 · 线粒体遗传
单碱基分辨率

每个修饰位点的位置与比例均可读出

m⁷G、m⁵C、ac⁴C、假尿嘧啶 Ψ、m¹A、m³C、二氢尿苷 D 与 2'-O-甲基化 Nm。 各类修饰均有对应的读出方式,无需抗体富集,结果可定位至具体位点。

  • 无抗体读出
  • 位点级定量
  • isoacceptor 分辨率
  • 匹配研究场景
tRNA 全栈研究平台示意:8 种修饰矩阵、测序峰图分析与无抗体直接读出
8 种修饰矩阵 · 测序峰图分析与修饰比例 · 无抗体直接读出
数谱生物 · tRNA 研究平台

tRNA 表达、氨酰化与修饰检测

在 tRNA 研究网络中,分析 tRNA 表达水平、检测氨基酸负载比例与鉴定修饰位点往往相互交织。 数谱生物为您科学整合各个模块、综合优化技术路线,全面助力您的 tRNA 创新研究。

  • 表达谱定量
  • 氨酰化比例
  • 修饰位点定位
  • 单碱基分辨率
tRNA 检测能力示意:表达谱定量、氨酰化比例、tRF&tiRNA 片段与单碱基修饰定位
表达谱定量 · 氨酰化比例 · tRF&tiRNA 片段 · 单碱基修饰定位

为什么选择数谱生物

数谱生物在 RNA 修饰与小 RNA 方向积累多年,tRNA 检测覆盖表达谱、氨酰化与单碱基修饰图谱, 同一份样本可完成多项分析。

了解我们的协作方式 →

tRNA 表达谱

  • 成熟 tRNA isoacceptor / isodecoder 定量
  • tRF 与 tiRNA 片段谱分析
  • qPCR 对单个靶标做验证
查看服务 →

tRNA 氨酰化

  • 一次实验读出 tRNA 表达水平
  • 同步获得修饰状态信息
  • 给出氨基酸负载比例
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修饰图谱与单碱基定位

  • m⁷G tRNA单碱基测序(TRAC-Seq) / m³C tRNA单碱基测序(HAC-Seq)
  • 8 类修饰的单碱基测序方案
  • LC-MS 修饰谱定量
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我们如何配合一项 tRNA 研究

以专业与专注,持续助力 tRNA 研究探索。

01

专业团队

汇聚多学科专业力量,为您的 tRNA 研究提供坚实支持。

02

规范流程

全流程规范化管理,各环节衔接顺畅、过程留痕可查。

03

完善交付

严谨的数据质控与完善的交付体系,助力科研成果产出。

针对 tRNA 的建库策略

tRNA 二级结构紧密、修饰密集,常规建库易受逆转录终止影响,我们的方法针对性地做了优化。

结果可追溯

每个位点均可回溯至原始读段与判据,便于复核与自查。

多方向的课题经验

在肿瘤、免疫、神经退行与代谢等方向均有 tRNA 项目经验,熟悉不同类型样本的常见问题。

新服务 · 单碱基分辨率的修饰图谱

直接读出修饰位点的位置与比例,无需抗体富集。按目标修饰选择方法,多个方法可并行开展。

完整的 tRNA 与 tRF&tiRNA 服务体系

表达谱、氨酰化与修饰检测可独立开展,也可依研究设计组合实施。

表达谱

tRNA 测序

定量成熟 tRNA 的 isoacceptor 与 isodecoder 表达水平,采用去甲基化酶处理降低修饰对逆转录的干扰。

表达谱

tRF&tiRNA 测序

tRF 与 tiRNA 片段谱分析,同时覆盖 miRNA、piRNA、sdRNA 等小 RNA,附注释与差异分析。

氨酰化

tRNA 氨酰化测序(mim-tRNA-Seq)

一次实验同时给出 tRNA 表达水平、修饰状态与氨基酸负载比例,适合研究翻译调控与代谢重编程。

修饰

tRNA 修饰测序(m¹A/m³C/m¹G/m2,2G)

一次实验同步完成四类修饰的位点分析,节省珍贵样本与实验周期,快速构建多修饰调控图谱。

修饰

m⁷G tRNA单碱基测序(TRAC-Seq)

针对 m⁷G 的靶向化学转化读出,定位到可变环第 46 位等位点并给出修饰水平。

修饰

m³C tRNA单碱基测序(HAC-Seq)

针对 m³C 的转化型读出,定位成熟 tRNA 上的 m³C 位点,适合与化学切割类方法互补验证。

质谱

LC-MS tRNA 修饰检测

液相色谱-质谱联用,可同时检测 55 种 RNA 修饰类型,给出修饰谱的整体定量结果。

验证

tRNA-qPCR

针对单个 tRNA 靶标的实时荧光定量,支持测序与芯片结果的验证,含去甲基化预处理方案。

验证

tRF&tiRNA-qPCR

针对单个 tRF 或 tiRNA 靶标的实时定量验证,适合对测序结果中少量关键片段做独立复核。

配套产品

部分环节可用配套的芯片、引物与试剂盒自行完成,结果可与我们的检测相互参照。

芯片

nrStar™ tRNA PCR芯片 (H/M)

在数小时内完成 tRNA isoacceptor 与 isodecoder 的表达谱检测。

芯片

nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片 (H/M)

针对 tRF 与 tiRNA 的高特异性表达谱检测方案。

芯片

NuRNA™ tRNA Modification Enzymes PCR芯片 (H)

一次检测 85 个 tRNA 修饰酶的表达水平,用于锁定候选调控酶。

引物

rtStar™ Pre-designed tRNA Primer Sets

针对单个成熟 tRNA 的定量引物组合。

引物

rtStar™ Pre-designed tRF&tiRNA Primer Sets

针对单个 tRF 与 tiRNA 的定量引物组合。

试剂盒

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment & First-Strand cDNA Synthesis Kit

处理 tRF 与 tiRNA 的末端结构并去除修饰屏障,提高 cDNA 合成效率。

解决方案

把检测手段按研究方向组织成一条证据链:先明确要回答的问题,再依次安排发现、定位、验证与解读。

肿瘤与转化

从标志物发现到治疗响应

测序全谱发现 + PCR 芯片队列验证,支持血清血浆等体液样本;也可用于靶点验证与耐药机制研究。

修饰与机制

从修饰图谱到酶的靶点

核苷修饰全谱定量与单碱基定位组合,把修饰、修饰酶与翻译结果串起来。

疾病与免疫

从疾病模型到 tRNA 机制

面向神经、代谢与感染免疫方向,按模型特点组合修饰定位、表达与片段检测。

tRNA 研究前沿

方法学解读、平台选择建议,以及客户文章的研究思路解析。

技术综述

tRNA 的复兴——从被动的翻译元件到主动的调控因子

梳理 tRNA 在翻译之外的调控功能与可切入的研究角度。

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技术综述

tRF&tiRNA:为什么以及如何研究它们

从生成机制讲到检测策略,说明不同研究目的下该看哪些指标。

阅读全文 →

方案指南

tRNA 研究方案选择指南

表达谱、氨酰化与修饰检测之间怎么排先后、怎么组合。

阅读全文 →

方法学解读

研究 small RNA 修饰的挑战与方法

测序与芯片各自的适用范围,以及什么情况下需要两者互补。

阅读全文 →

研究思路

tRNA 生物学重要性及研究思路

tRNA 的生物学意义与课题设计思路。

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客户文章

Nature Cancer|tRNA m1A 修饰促进结直肠癌的新机制

看 tRNA 修饰测序如何在肿瘤机制研究中提供关键证据。

阅读全文 →

二十余年 · 表观转录组与非编码 RNA 研究

数谱生物(Aksomics)

数谱生物以表观转录组学与非编码 RNA 为核心技术方向,在 tRNA 与 tRF&tiRNA 方向形成了从样本处理、 文库构建、测序到生物信息分析的完整流程——覆盖表达谱定量、氨酰化比例测定与单碱基修饰图谱三个层面, 并配有芯片、定量 PCR 与质谱等验证手段;公司平台同时覆盖其它组学方向。

总部位于上海,并在国内多地设有办事处,是 ISO9001 质量管理体系认证单位。团队与国内多家科研院所、 医疗机构保持长期合作,帮助客户把 tRNA 层面的检测结果用在肿瘤、免疫、神经与代谢等方向的研究中。

  • 500+Small RNA 优质SCI数量
  • 3200+客户发文数量
  • 17200+文章影响因子总和
  • 5000+长期合作伙伴

如需推进 tRNA 相关研究,欢迎与我们联系

期待与您携手,共同探索 tRNA 研究的更多可能。

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