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常见问题

来自实际项目的高频咨询整理。

内容导读

这里的常见问题来自实际项目中的高频咨询,按服务流程整理。如果没找到对应的问题,可以联系我们进一步说明。

常见问题

样本怎么准备和寄送?
样本类型不同准备方式也不同:组织样本建议液氮速冻后低温运输,细胞样本按常规方式收集,血液样本需使用合适的抗凝管。寄送前请与我们确认保存条件与运输方式。
结果不满意或数据异常怎么办?
各环节设有关键质控点。若结果不达预期,我们会先定位原因,再与您商定重做或调整方案。
分析结果有疑问找谁?
由项目负责人对接。关键结论可回溯至原始数据与判据,可以逐项核对。
能同时做多个方向的检测吗?
可以。同一份样本可以做多项检测,我们会按研究设计安排先后顺序,尽量减少样本消耗。
mim-tRNA-Seq 报告里 Charging 的差异用什么标准筛选?
Charging 是百分数(0–100%),不能只按倍数变化判断。举例来说,Charging 从 60% 升到 80%,实际上升了 20 个百分点,但倍数只有 1.33 倍,按"FC ≥ 1.5 且 P < 0.05"就可能筛不出来。因此报告会同时给出倍数变化与 Charging 分值的绝对差值,并以 Charging 差值 ≥ 10 个百分点作为常用的筛选标准,两者结合看更不容易漏掉有实际意义的水平变化。样本量有限、修饰位点数量不多时,单纯用 FC + P 值组合筛出空结果也属于常见情况。
tRNA 测序为什么提供 ucount 和 mrcount 两套差异结果?
两套结果对应两类读段:ucount 指读段唯一比对到某一种 tRNA,mrcount 指读段可以比对到多种 tRNA。唯一比对的定量更确定,一般优先看 ucount;但有些 tRNA 之间序列相似度很高,能唯一比对的读段本来就少,只看 ucount 会漏掉这些成员。建议以 ucount 为主,再用 mrcount 复核,两者综合判断差异是否可靠。
做 LC-MS 修饰检测前,需要先确认哪些信息?
建议先明确三件事:① 检测对象是 tRNA 还是 mRNA(或其他 RNA);② 物种——原核生物与古菌需要提前说明;③ 关注的是哪一类修饰。若关注的是未收录的修饰类型,或需要与结构相近的修饰区分开,建议提供相应的标准品,以便在报告中单独判定。若只做整体修饰谱筛查,可以直接检测,但需要了解并非所有修饰都有对应标准品,结果更适合作为筛选线索。