tRNA 与 tRF&tiRNA 研究相关服务
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关于我们

本页对应的平台,是数谱生物面向 tRNA 与 tRF&tiRNA 研究的服务门户。公司以表观转录组学与非编码 RNA 为核心技术方向,在 tRNA 方向上覆盖表达谱定量、氨酰化比例与单碱基修饰图谱三个层面,并配有芯片、定量 PCR 与质谱等验证手段。

公司概况

数谱生物经过二十余年的发展,已建立起以表观转录组学与非编码 RNA 为核心的多组学技术平台;其中 tRNA 与 tRF&tiRNA 方向形成了从样本处理、文库构建、测序到生物信息分析的完整流程。公司总部位于上海,并在国内多地设有办事处,是 ISO9001 质量管理体系认证单位。

作为美国 Arraystar 公司在中国的独家代理服务商,Aksomics 生命科学实验中心配备了实验设备,拥有一支经验丰富的实验技术团队和生物信息学团队,为科研工作者提供实验与技术支撑。

技术平台

tRNA 检测与测序平台

tRNA 测序、tRF&tiRNA 测序、tRNA 氨酰化测序(mim-tRNA-Seq)、tRNA 修饰测序,以及 tRNA-qPCR、tRF&tiRNA-qPCR 等靶标定量验证服务。

单碱基修饰定位平台

m⁷G TRAC-Seq 与 m7G-Quant-Seq、m³C HAC-Seq 与 m3C-IP-Seq、m⁵C BS-seq、m¹A-Quant-seq、假尿嘧啶 Ψ(BACS-seq / BID-seq)、二氢尿苷 CRACI-seq、2′-O-甲基化 NM-seq。

芯片与定量 PCR 平台

nrStar™ tRNA PCR 芯片、nrStar™ tRF&tiRNA PCR 芯片、NuRNA™ tRNA Modification Enzymes PCR 芯片、rtStar™ Pre-designed 引物组合与配套试剂盒。

质谱与其它方向

LC-MS 用于 tRNA 碱基修饰的整体定量;公司平台同时覆盖 RNA 糖基化、G4 与 R-loop、表观基因组学、DNA/RNA/蛋白相互作用、翻译组学与单细胞测序等方向。

质量体系

  • 体系认证:公司为 ISO9001 质量管理体系认证单位,流程按规范文件执行。
  • 分环节质控:样本接收、建库、上机与分析各环节设有关键质控点,结果不达预期时先定位原因。
  • 过程可追溯:分析结果中的关键结论可回溯至原始数据与判据,便于复核与自查。
  • 平台自持:转化、建库、测序与质谱检测在同一流程下运行,批次间数据可比。

合作与成果

公司已与中国科学院、北京大学医学部及附属医院、中山大学医学院及附属医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学医学院附属中山医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院等国内科研院所和医疗机构建立了长期合作关系,协助客户在 Cell、Nature Medicine、Nature Genetics、Nature Immunology、Cancer Cell、Molecular Cell、Circulation、Hepatology 等国际期刊上发表 SCI 论文。

在非编码 RNA 领域,客户使用本公司技术服务发表的 SCI 文章已超过 2300 篇,累计影响因子突破 10000 分,其中 Small RNA 领域相关文章 500 余篇;各技术平台累计支持客户发表 SCI 论文总数已超过 3200 篇,累计影响因子突破 17200 分。

tRNA 与 tRF&tiRNA 检测是其中的组成部分。近年肿瘤、免疫、神经与代谢等方向均有课题组基于这些检测结果发表论文,内容涵盖 tRNA 表达谱、修饰定位与氨酰化测定。

愿景与使命

愿景

促进生命科学研究技术的发展与创新。

使命

聚焦生命科学发展的挑战,提供有竞争力的产品和服务,持续为客户创造价值。

常见问题

本平台主要提供哪些 tRNA 相关服务?
围绕 tRNA 与 tRF&tiRNA 提供四类服务:表达谱定量(tRNA 测序、tRF&tiRNA 测序)、氨酰化比例测定(mim-tRNA-Seq)、修饰检测(tRNA 修饰测序与 LC-MS)与单碱基修饰定位(m⁷G、m³C、m⁵C、m¹A、Ψ、D、Nm 等方法),另有 tRNA-qPCR、tRF&tiRNA-qPCR 与配套芯片可用于靶标验证。公司平台的其它研究方向可在门户首页的服务与产品栏目中查看。
与 Arraystar 是什么关系?
数谱生物是美国 Arraystar 公司在中国的独家代理服务商。Arraystar 的芯片产品与我们一起为客户提供从实验到数据分析的服务,相关的产品线在官网产品栏目中可以查到。
数据分析由谁完成?
数据分析由公司内部的生物信息学团队完成,与实验环节在同一流程下衔接。交付时提供分析结果与说明材料,关键结论可回溯至原始读段与判据,便于复核。
对分析内容有疑问时怎么处理?
分析说明随结果一并提供。如对分析内容有疑问,可以联系项目负责人,关键结论可回溯至原始数据与判据,便于逐项核对。