tRNA 测序 | tRNA 表达谱检测服务

服务优势

针对 tRNA 优化的建库策略：tRNA 二级结构紧密、修饰密集，常规 small RNA 建库容易受逆转录终止影响，本方案针对这一特点做了针对性优化。
去甲基化处理流程：在逆转录前去除修饰核苷酸的干扰，进一步提升检测效率与定量准确性。
参考库覆盖完整：tRNA 参考库综合多个权威数据库，覆盖细胞核与线粒体来源的 tRNA。
注释信息详尽：除表达量外，同时提供数据库来源、基因组位置、碱基序列与二级结构等信息。
结果呈现清晰：差异分析结果以热图、散点图、火山图等形式输出。
可与其他平台衔接：同一份样本可继续用于 tRNA 修饰定位、氨酰化检测或 LC-MS 修饰定量。

tRNA 测序是一种以高通量测序方式定量成熟 tRNA 表达水平的方法。它针对 tRNA 稳定的二级结构与密集的核苷酸修饰优化了文库构建与逆转录条件，可给出各 tRNA isoacceptor 与 isodecoder 的表达量，用于研究密码子偏好性、翻译调控与疾病机制。

不同机体组织与细胞的转录组存在差异，不同 mRNA 的密码子使用偏好性也不同，因此所需的 tRNA 库存在显著差别。tRNA 库与转录组密码子的匹配度会影响翻译效率与准确性，增殖、分化、凋亡等细胞状态都伴随 tRNA 库的变化。

已有研究表明，tRNA 库的变化与肿瘤、Ⅱ型糖尿病、亨廷顿舞蹈症以及病毒感染等疾病的发生发展相关。而 tRNA 的稳定二级结构与高修饰水平，也使常规 small RNA 方案难以获得准确结果。

特定 tRNA 的表达变化可以驱动基因表达改变并影响肿瘤进展，说明 tRNA 库本身是翻译调控的组成部分，而不只是被动参与蛋白合成。 Goodarzi H, et al. Cell 165, 1416-27 (2016). PMID: 27259150

样本接收与质检RNA 完整性与纯度

去甲基化处理降低修饰干扰

文库构建tRNA 专用方案

高通量测序按项目规模配置数据量

生物信息分析定量与差异分析

给出各 tRNA 的表达量，并提供数据库来源、基因组位置、碱基序列与二级结构等注释信息，便于后续研究使用。

比较不同组别之间的 tRNA 表达谱，挖掘差异表达分子，通过热图、散点图、火山图等形式展示样本间差异。

分析过程遵循规范流程，具体参数与说明随结果一并提供，便于后续整理与使用。

tRNA 测序与常规 small RNA 测序有什么区别？

差别主要在文库构建策略。tRNA 二级结构紧密、修饰密集，常规 small RNA 方案在逆转录阶段容易提前终止，导致检出率偏低、定量偏差较大。tRNA 专用方案针对这些特点优化了建库与逆转录条件，并加入去甲基化处理，因此更适合用于 tRNA 表达谱研究。

为什么需要在建库前做去甲基化处理？

tRNA 上存在大量甲基化修饰，这些修饰会在逆转录时造成碱基错配或延伸终止，进而影响定量准确性。去甲基化处理可以降低这类干扰，减少因修饰造成的读段丢失，使表达量结果更接近真实水平。对于修饰密度较高的 tRNA 分子，这一处理带来的改善更为明显。

可以分析哪些类型的 tRNA？

参考库覆盖细胞核与线粒体来源的 tRNA，可给出 isoacceptor 与 isodecoder 两个层面的表达量。isoacceptor 指携带同一氨基酸但反密码子不同的 tRNA，isodecoder 指反密码子相同但其它序列存在差异的 tRNA，两者在不同研究问题中的价值不同。

样本类型与样本状态有什么要求？

支持 total RNA、细胞、组织与血液等样本类型。由于 tRNA 对降解较为敏感，样本采集后建议尽快低温保存，避免反复冻融。具体样本准备方式可参照送样指南，或在寄送前与我们的技术人员确认。

能不能同时分析 tRF 与 tiRNA？

可以。tRNA 来源的小 RNA 片段（tRF）与应激条件下产生的 tiRNA 属于另一类分析对象，由 tRF&tiRNA 测序承担。若研究希望同时了解成熟 tRNA 的表达与来源片段的分布，可以把两个项目安排在同一批样本上，便于结果对照。

结果会提供哪些内容？

交付内容包含原始数据、tRNA 表达定量结果与差异表达分析结果。表达定量表中附带数据库来源、基因组位置、碱基序列与二级结构等注释信息，便于后续整理与使用。

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