tRNA m7G TRAC-Seq 与 m3C HAC-Seq 测序服务

相比只看整体丰度的方案，它们能给出"哪个位点、修饰到什么程度"的信息。

两种方法各自解决什么问题

TRAC-seq 与 HAC-Seq 都是把化学处理与高通量测序结合的单碱基分辨率修饰检测方法：化学试剂选择性作用于目标修饰，使其在逆转录时留下可识别的特征，再通过对这些特征的比对与计数，把修饰位点落到单个核苷酸上，并在全转录组范围内绘制位点图谱。相比只看整体丰度的方案，它们能给出"哪个位点、修饰到什么程度"的信息。

m⁷G：TRAC-Seq

TRAC-Seq 针对 tRNA 的 m⁷G：还原性切割在修饰位点留下断点，据此定位并定量 m⁷G 位点。它的特点有三处——一是分辨率到单碱基；二是依靠化学反应而非抗体亲和，避免非特异性结合带来的背景；三是覆盖度：配合 Arraystar rtStar™ tRNA Pretreatment Kit 的去甲基化步骤，可以缓解 tRNA 上密集修饰对逆转录的阻碍，让修饰密布的 tRNA 也能拿到足够深度。数据分析除位点外，还会给出 m⁷G 相关的序列特征（如 RAGGU motif）分析。

m³C：HAC-Seq

HAC-Seq 针对 tRNA 的 m³C：肼-苯胺切割在 m³C 位点断裂，5′ 片段因末端受损无法建库，测序只捕获全长片段与 3′ 切割片段，通过两类读段的分布差异判定切割位置，同样落在单核苷酸水平。它的可靠性来自对照设计——同批样品设去甲基化处理组（DM-HAC），修饰被去除后该位点的切割消失，两组相减即可把真实位点从背景中分离出来。分析同样支持同步挖掘保守序列基序。

可以和什么搭配

两种方法都定位到具体核苷酸，因此可以互相印证，也能与 tRNA 测序、tRNA 修饰测序（m¹A/m³C/m¹G/m^2,2G）、LC-MS 修饰定量在同一批样本上组合，从表达、氨酰化到修饰位点连成一条完整的分析链。