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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
Arraystar 表观遗传芯片
● 聚焦于功能性的表观遗传敏感区域: Arraystar精心设计的表观遗传系列芯片聚焦于蛋白编码基因/非编码RNA的启动子区域，或是癌症相关的Block以及DMR区域；能够帮助研究者快速、准确地了解这些疾病敏感位点的表观修饰变化。
● 专为MeDIP/hMeDIP-chip以及ChIP-chip设计: 可用于 DNA甲基化/DNA羟甲基化，组蛋白修饰，转录因子结合以及染色质重塑等表观遗传学研究。
● 可信赖的检测平台及数据结果：优化的IP步骤，抗体富集效率高，特异性好；高效荧光标记及双通道检测系统；卓越的芯片质量以及技术重复性。
● 与表达谱芯片平台的联合应用：可与Arraystar LncRNA Expression Microarray联合应用分析表观对基因表达的调控。
★ 聚焦蛋白编码基因启动子或非编码RNA启动子区域
基因启动子区是表观遗传修饰的研究重点。启动子区域DNA甲基化、DNA羟甲基化以及组蛋白修饰精细地调控基因的表达。除了蛋白编码基因，长链非编码RNA(lncRNA)及miRNA在基因组中广泛转录，某些lncRNA表达的细胞特异性和组织特异性甚至高于蛋白编码基因，而表观调控正是这些lncRNA和miRNA表达特异性的基础。
Arraystar启动子芯片是专门为研究启动子区域的DNA甲基化/羟甲基化、组蛋白修饰以及转录因子结合而设计的产品，覆盖所有Refseq数据库基因的启动子区域（Arraystar Refseq Promoter Array）或是所有长链非编码RNA以及重要miRNA的启动子区（Arraystar ncRNA Promoter Array）,能够满足不同研究者的需求。Tilling探针设计覆盖范围近2kb启动子区域（图1）,同时涵盖启动子区附近的CpG岛，是一款高品质、高性价比的表观芯片产品。
图1. 启动子芯片检测范围及应用
★ 聚焦癌症特异性大规模表观遗传变化区域
研究表明:多种癌症中普遍存在着一些连续的大范围低甲基化区间（block）。癌症中95%的DNA甲基化改变都发生在这些区域。Block的长度在5kb到10M之间，长度中位值为28kb。与传统认识不同，这些block区域富含基因，包含了约整个基因组的1/3的基因转录起始位点。此外，这些低甲基化block与包括LADs*和LOCKs*在内的异染色质区域存在很大重叠，表明癌症中的甲基化变化与染色质结构改变之间存在很大的关联性。而且相对于正常组织，这些区域不仅整体DNA甲基化水平下降；它们在不同肿瘤样品中的甲基化水平变化更加剧烈。这种个体间甲基化水平的剧烈波动可能是癌症重要特征——肿瘤异质性——的深层分子机制，并与癌症的发生、发展密切相关。
注：*LADs:与核纤层蛋白结合的DNA区域；*LOCKs:富含抑制性组蛋白修饰（H3K9二甲基化）的染色质区域。
Arraystar Human Cancer Block芯片是专门为研究癌症相关的block区域而设计的产品。可检测block区域中蛋白编码基因，lncRNA及microRNA转录区域的DNA甲基化、组蛋白修饰以及转录因子结合的变化。
图2. 癌症样品低甲基化block中表达水平变化剧烈的26个基因。肿瘤组织中（红色）个体间表达变化范围大于正常样品（蓝色）
★ 聚焦癌症特异性小范围DNA甲基化变化区域
癌症中除了低甲基化的长区间（block）还存在许多长度小于5kb的特征性甲基化区域（Cancer-specific DMRs）。目前已发现超过1万个的癌症特异性DMR区域。在癌症中，高甲基化主要发生在CpG岛（~5，800），低甲基化主要发生在CpG岛边缘、上下游2kb范围的，称为CpG岛岸的区域（~4，000）。这些区域是癌症甲基化变化的敏感位点，可根据甲基化界限的变化类型分成四类：当甲基化边界向CpG岛外部移动（a），CpG岛岸发生低甲基化；当甲基化边界向CpG岛内部移动或消失（b,c）时，CpG岛超甲基化; 此外还有去甲基化形成新的低甲基化区域（d）。癌症中甲基化界限的漂移与关键基因的表达改变密切相关。
Arraystar Cancer-specific DMR芯片是专门为研究癌症相关的差异甲基化区域而设计的产品。覆盖12113个癌症及细胞特异性的甲基化差异敏感区域以及相关的CpG岛和CpG岛岸。Arraystar Cancer-specific DMR芯片不仅能检测到样品间的甲基化变化还能帮助了解其中的CpG岛甲基化界限漂移，以全新的视角研究肿瘤表观组学。
图3. DMR区域丧失甲基化稳定性的模式。图中横轴代表基因组特定区域，纵轴代表相应位点的甲基化程度，蓝色的线代表正常样品，红线代表癌症样品，DMRs区域用粉红色的背景标记。癌症相关的甲基化变化可以分为四类主要的模式：（a）甲基化边界外移；（b）甲基化边界内移；（c）甲基化边界消失；（d）通过去甲基化形成的新的DMR区域。
★ 芯片参数
