RNA测序

  • 简介
  • 服务特点
  • 结果展示
  •       相对于传统的芯片杂交平台,RNA测序无需预先针对已知序列设计探针,即可在转录本水平和基因水平对整体转录活动进行检测。并且具有定量更准确,检测通量更高,检测范围更广等优点。此外,在分析转录本的结构和表达水平的同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及可能的点突变,提供最全面的转录组信息。

    Aksomics(康成生物)基于Illumina高通量测序平台,为您提供一站式RNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,Aksomics的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括RNA抽提、rRNA去除、文库构建、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。



  • 1.采用rRNA去除方法富集,检测更为全面

           采用去rRNA的方法进行RNA富集,同时保留带PolyA尾和不带PolyA尾的RNA,为您的研究提供全面可靠的数据。


    *图释Aksomics的RNA富集方案能够有效的保留带PolyA尾巴和不带PolyA尾巴的转录本,从而为客户提供更加全面可靠的数据。  


    2.可采用降解的RNA进行实验,特别适用于临床样品(如FFPE样品)的检测

           Aksomics采用的去rRNA试剂盒能够有效的去除降解的rRNA,对功能性的RNA分子进行有效的富集, 特别适用于临床样品的检测。


     

    *图释:Aksomics的RNA富集方案适用于降解的RNA样品。 


    3.链特异性文库构建

           采用的链特异性文库构建方法,可以有效区分正义链和反义链,帮助您同时获得准确的正义链和反义链RNA的表达信息。

     

    *图释:Aksomics采用链特异性的建库方法,可以有效区分正义转录本和反义转录本。


    4.均匀覆盖转录本,5’和3’端偏好性低

           采用基于dUTP的建库方案,Reads均匀覆盖转录本,测序结果更可靠。


     

    图释:启动子区的RNA-SeqChIP-Seq可视化信号


  • 1.基因集富集分析(GSEA):利用一列(排序的)基因进行基因集富集分析,能够揭示这些基因在不同基因集间的富集情况。


     

    图释:基因集富集分析显示在Cell Cycle Pathway基因集中富集


    2.网络分析:通过GO富集分析挑选感兴趣的GO term,对其中的基因构建基因网络图。


    图释:GO term-基因网络图,绿色和蓝色:特异基因;红色:共有基因


    3. RNA-Seq和ChIP-Seq整合分析:通过整合RNA-Seq结果和ChIP-Seq富集峰,能够更直观地了解基因启动子区的特征。


    图释:启动子区的RNA-Seq和ChIP-Seq可视化信号