tRNA碱基修饰检测

  • 简介
  • 分析种类
  • 结果展示
  • Aksomics(康成生物)的质谱检测平台能够为客户提供全面而准确的tRNA修饰谱。利用Agilent质谱仪,检测36种修饰碱基在各个样品中的修饰丰度。


    服务特色:

    ● 优化的前期处理与Agilent优质设备 

    ● 全面而准确的碱基修饰分析


    分析流程:

    图释:LC-MS tRNA修饰检测服务流程图。


  • Number Nucleoside Symbol Number Nucleoside Symbol
    01 3′-O-methyladenosine 3′-OMeA 19 1-methylguanosine m1G
    02 2′-O-methylcytidine Cm 20 7-methylguanosine m7G
    03 5-methylcytidine m5C 21 N2-methylguanosine m2G
    04 N6-isopentenyladenosine i6A 22 3′-O-methylinosine 3′-OMeI
    05 5,2′-O-dimethylcytidine m5Cm 23 2-thiouridine s2U
    06 1-methyladenosine m1A 24 4-thiouridine s4U
    07 2-thiocytidine s2C 25 5-methyluridine m5U
    08 N2,N2,7-trimethylguanosine m2,2,7G 26 N4-acetylcytidine ac4C
    09 N4-acetyl-2′-O-methylcytidine ac4Cm 27 3′-O-methyluridine 3′-OMeU
    10 N6-methyladenosine m6A 28 5-methyl-2-thiouridine m5s2U
    11 3-methylcytidine m3C 29 5-methoxyuridine mo5U
    12 3′-O-methylcytidine 3′-OMeC 30 pseudouridine Ψ
    13 2′-O-methyladenosine Am 31 2′-O-methylinosine Im
    14 N2,N2-dimethylguanosine m22G 32 3-methyluridine m3U
    15 5′-O-methylthymidine 5′-OMeT 33 3′-O-methylguanosine 3′-OMeG
    16 2′-O-methyluridine Um 34 1-methylpseudouridine m1Ψ
    17 inosine I 35 5-hydroxymethylcytidine hm5C
    18 2′-O-methylguanosine Gm 36 5,2′-O-dimethyluridine m5Um
  • 1. 修饰定量分析

    图释:tRNA修饰数量分析图。


    2. 总离子流程图

    图释:总离子流程图


    3. 不同离子对合并Peak图

           优化的前期处理与Agilent优质设备,确保了各修饰碱基之间具有很好的区分度。

    图释:不同离子对合并Peak图。


    4. 差异性tRNA修饰

           对不同样本间的修饰丰度进行比较分析,发现具有差异修饰的核苷酸。这些修饰的差异可能导致tRNA在合成、稳定性以及功能发挥等方面明显的差异。

    图释:tRNA修饰Heatmap图。