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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
rtStar™ tRF&tiRNA预处理试剂盒用于qPCR的cDNA合成之前的tRF & tiRNA样品制备。该试剂盒通过去除tRF和tiRNA片段中经常存在的3’环磷酸和5’羟基，产生了可以连接接头的3’羟基和5’磷酸末端。tRF和tiRNA片段内部的 m1A、m1G 和 m3C修饰也被去甲基化以实现高效的 cDNA 逆转录。
rtStar™ tRF&tiRNA第一链cDNA合成试剂盒将预处理的 tRF 和 tiRNA 片段转化为用于 qPCR 反应的 cDNA。 该方法依次将 3'-Adaptor 连接到 RNA 的 3'-末端，将 5'-Adaptor 连接到 RNA 的 5'-末端。
产品优势
•有效去除内部修饰以确保 cDNA 合成过程中逆转录酶的顺利进行，解除修饰对常规cDNA合成的影响
•进行末端修复，以保证产生适合连接接头的3’羟基和5’磷酸末端
•有效区分tRF&tiRNAs和其前体
•与未处理的样本相比，预处理极大地增加了tRF&tiRNA检测的灵敏度、定量精确性和检出区分度
本试剂盒建议与nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片或rtStar™ Pre-designed tRF&tiRNA Primer Sets搭配使用，不建议用于其他研究使用。
| 产品名称 | 货号 | 规格 | 产品描述 |
|---|---|---|---|
| rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Ki | AS-FS-005 | 12 Reactions | 3’氨酰基末端去除 3‘环磷酸末端去除 5’羟基末端磷酸化 m1A、m1G、m3C去甲基化 |
| rtStar™ tRF&tiRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit | AS-FS-003 | 6 Reactions | 依次将 3'-Adaptor 连接到 RNA 的 3'-末端，将 5'-Adaptor 连接到 RNA 的 5'-末端 |
| rtStar™ tRF&tiRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit | AS-FS-003-02 | 12 Reactions | 依次将 3'-Adaptor 连接到 RNA 的 3'-末端，将 5'-Adaptor 连接到 RNA 的 5'-末端 |
tRFs&tRF&tiRNA是一类由tRNA发生精确切割而产生的非编码小RNA分子，近来研究表明，这类小RNA分子具有多种生物学功能，比如类似于microRNA参与RNA干扰；调节靶向mRNA的稳定性；在细胞应激条件下促进应激颗粒(SG)的组装；以及调控细胞凋亡等。此外，tRFs&tiRNAs还与癌症、神经退行性疾病等多种疾病紧密关联。 然而，tRF&tiRNAs 的分子特性对其精确的表达定量造成了挑战。 由于其独特的前体与切割方式，tRF&tiRNAs携带有多种内部或末端修饰。tRF和tiRNA可能保留了来源的tRNA上的甲基化修饰（m1A、m1G和m3C等）和氨酰基末端，tiRNAs常由RNA内切酶Angiogenin切割产生，这类内切酶会在切割位点产生5‘羟基（5’-OH）末端与3’环磷酸（3‘-cP）末端。许多当前标准的cDNA文库构建方法，特别是针对小非编码RNA的方法，包含了将3’和5’寡核苷酸接头连接到RNA的3’和5’末端的接头连接步骤，需要底物小RNA 5’端为磷酸，3‘端为羟基。此外，tRFs&tiRNAs的内部修饰比如m1A, m1G与m3C会严重阻碍反转录过程。为了准确检测tRFs&tiRNAs，这些修饰必须被有效的去除。
图1. tRF&tiRNA的常见修饰可以干扰接头连接和cDNA合成，从而显著降低cDNA文库构建的质量
此外，tRF&tiRNAs 是通过精确的生物发生过程从 tRNA 或 pre-tRNA 产生的。 传统的 qPCR 很难将 tRF&tiRNA 与其前体（tRNA 或 pre-tRNA）区分开来，因为它们共享相同的序列。 为了实现 tRFs&tiRNAs 的高保真和准确定量，Arraystar 开发了一个优化的检测系统，由两个产品组成：rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit 和 rtStar™ tRF&tiRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit。 预处理试剂盒旨在去除 tRF和tiRNA的内部和末端修饰。 通过在 tRF&tiRNA 的 3' 和 5' 端引入两个人工序列，第一链cDNA试剂盒可以有效地将 tRF&tiRNA 与其前体和其他小 RNA 区分开来。
