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基因芯片技术服务 m6A单碱基分辨率芯片 m6A-mRNA&lncRNA表观转录组芯片 m6A-circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
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基因芯片技术服务 lncRNA芯片 超级增强子lncRNA芯片 环状RNA芯片 LncPath芯片 microRNA 芯片 全基因表达谱芯片 T-UCR芯片 piRNA芯片 |
NGS测序技术服务 RNA测序 tRNA测序 tRF&tiRNA测序 microRNA测序 Ribo seq |
PCR芯片技术服务 nrStar™ ncRNA系列PCR芯片 NuRNA™ mRNA PCR芯片 SAB功能分类PCR芯片 |
PCR技术服务 LncRNA实时定量PCR 环状RNA实时定量PCR microRNA实时定量PCR tRF&tiRNA实时定量PCR mRNA实时定量PCR |
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LC-MS |
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基因芯片技术服务 DNA甲基化芯片 DNA羟甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS测序技术服务 DNA甲基化测序 DNA羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相对定量 TMT标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 TMT标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
Arraystar m6A单碱基分辨率芯片利用RNA酶MazF对m6A敏感的特性，可在单碱基分辨率水平定位m6A位点，并对其进行定量。该芯片具有其它现存技术难以企及的优势，是研究m6A动态变化、生物学功能以及疾病相关性的强大工具。Arraystar m6A 单碱基分辨率芯片技术拥有以下多种经典m6A-Seq分析技术所不具备的优点：
• 一种检测m6A的正交实验方法：与以m6A抗体免疫共沉淀为基础的MeRIP或miCLIP等技术不同，芯片首次提供了一种不依赖于抗体的m6A系统性检测方法。点击了解详情>>
• 单碱基分辨率水平定位m6A位点：MeRIP-Seq技术的分辨率在100~200 nt左右，不能精准定位m6A，而芯片利用MazF酶，可在单碱基分辨率水平，准确检测m6ACA位点。点击了解详情>>
定量m6A修饰。芯片可对m6ACA位点进行定量，解决了检测m6A动态变化这个长期未得到满足的科研需求。点击了解详情>>• 样本需求量少：与MeRIP-Seq需要> 100 ug RNA相比，芯片仅需要1 ug总RNA，适用于稀有样本，珍贵病理样本，尤其是组织部位、低产量的筛选细胞以及小的动物模型等样本。点击了解详情>>
• 可靠的位点收集与系统性注释：Arraystar建立了特殊的收集注释流程，对Single-ACA、Poly-ACA和Cluster-ACA上的可定量m6A位点进行了可靠收集和系统性注释。了解这些m6A位点的功能意义，请点击此处。
Aksomics（原康成生物）是Arraystar中国区唯一代理商，独家为您提供Arraystar公司m6A单碱基分辨率芯片全程一站式技术服务。您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，Aksomics的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并提供完整的实验报告。同时，根据您的研究需要，Aksomics还提供各种深入数据挖掘服务。
Arraystar m6A单碱基分辨率芯片产品列表
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服务 |
描述 |
规格 |
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Human m6A 单碱基分辨率芯片服务 |
14,328 m6ACA sites |
8×15K |
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Mouse m6A单碱基分辨率芯片服务 |
14,325 m6ACA sites |
8×15K |
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Rat m6A单碱基分辨率芯片服务 |
14,790 m6ACA sites |
8×15K |
RNA酶MazF可识别单链RNA上的ACA序列，并在第一个A的5’端进行切割，而如果第一个A携带m6A修饰（即m6ACA），则不能发生切割[5, 10]（图1）。对经过MazF酶处理，因具有m6ACA序列而未被切割的RNA片段，以及未经MazF酶处理的Input RNA，进行双色标记，然后与Arraystar单碱基分辨率芯片杂交，从而得到单碱基分辨率水平的m6A定量值（图2）。该技术不依赖于半定量的m6A抗体免疫共沉淀技术，因此定量更加准确。
图 1. MazF 酶切割未甲基化的（ACA）序列而不切割甲基化的（m6ACA）序列。
Arraystar单碱基分辨率芯片实验流程包括：
• 总RNA片段化处理与DNase消化；
• MazF酶处理，切割未甲基化的（ACA）序列而保留完成的甲基化（m6ACA）序列。等份的未经MazF酶处理的RNA作为Input；
• 加入外参RNA Spike-ins，用作杂交信号校正；
• 分别合成cRNA，Cy5（红光）标记MazF酶处理的样本，Cy3（绿光）标记未经MazF酶处理的样本；
• 将两种荧光标记的cRNA混合，并与Arraystar单碱基分辨率芯片杂交；
• 双色信号通道芯片数据分析与注释。
图2. Arraystar单碱基分辨率芯片实验流程。
m6A单碱基分辨率芯片结果提供丰而详细的生物信息学分析与注释，包括单碱基m6A化学计量、m6A定位、位点类型（Single-, Multiple-, clustered m6A位点）、转录本区域等等。它们是理解m6A动态变化、生物学功能、分子机制和疾病相关性的必要信息，是目前其它技术所无法提供的。
