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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
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动脉粥样硬化是一种脂质代谢与炎症性血管病变，是引起心脑血管时间的常见疾病，。来自广州南方医院的研究者发现动脉粥样硬化新的分子机制，解释了斑块形成过程中非编码RNA RP5-833A20.1如何通过microRNA和转录因子调控了炎症因子以及细胞内的脂肪运输过程，有可能对疾病治疗产生重要影响。文章发表在2015年《Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology》 （影响因子6.0）。（芯片实验由康成提供技术服务）
研究背景： 动脉粥样硬化斑块的形成与血管内皮细胞，血管平滑肌细胞以及巨噬细胞有关。巨噬细胞吞噬大量氧化型低密度脂蛋白胆固醇，导致细胞内脂质堆积，形成泡沫细胞从而促发了动脉粥样硬化的炎症反应；构成脂质核心和动脉粥样硬化病变。lncRNA的研究得到了世界范围的关注。此前虽然有发现心血管相关lncRNA的报道，然而数目有限，该领域还有广阔的研究空间。
研究思路： 该研究利用THP-1巨噬细胞和THP-1来源的泡沫细胞进行比较，找到100个差异表达的lncRNA,63个mRNA分子（差异倍数大于3，p值小于0.01）。通路网络分析表明差异表达的基因参与动脉粥样硬化，G蛋白耦联受体等重要通路。从差异表达的分子中选择与疾病相关的转录因子NFIA以及位于其内含子中的lncRNA RP5-833A20.1进行深入研究。 过表达和干扰实验证明lncRNA RP5-833A20.1对NFIA具有负调控作用。分子机制实验中发现mir-382-5p可结合NFIA的3’ UTR区域抑制NFIA的 表达，而RP5-833A20.1参与了mir-382-5p的成熟加工过程。体外细胞实验证明RP5-833A20.1/mir-382-5p/NFIA通路调控了炎症细胞因子的表达以及细胞内的脂肪聚集；小鼠活体实验发现NFIA过表达显著抑制斑块的形成，降低循环系统中的炎症因子浓度，促进胆固醇代谢的作用，是可能的动脉粥样硬化治疗靶点。
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