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单细胞测序技术服务 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 单细胞全转录组测序 |
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生物分子凝聚体研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
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NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
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NGS测序技术服务 环状DNA测序 |
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基因芯片技术服务 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表观转录组学测序服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖体-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
第二军医大学孙树汉教授课题组长期致力于肝癌的研究。其课题组使用Arraystar LncRNA芯片研究肝癌，连续发表了6篇SCI文章，其中4篇发表在Hepatology；近期，其课题组的研究成员发现了能抑制肝癌转移的新分子：lncRNA-LET，该研究成果刊登在Molecular Cell上。（ LncRNA芯片实验均由康成提供技术服务）
研究背景
缺氧环境对肝癌，结肠癌，肺鳞癌的转移发挥关键作用。近来的研究发现lncRNA在多种肿瘤中异常表达并调控肿瘤的转移，但是，对于肿瘤中lncRNA表达调控的分子机制仍不清楚。孙树汉教授课题组本次研究目的在于揭示缺氧，lncRNA表达，肿瘤转移之间的关联。
研究思路
研究者应用美国Arraystar公司的Human lncRNA芯片对5例肝癌组织和5例癌旁组织的lncRNA表达谱进行了比较，其中lncRNA-LET在肝癌组织中特异性低表达。并且验证发现lncRNA-LET在肝癌，结肠癌和肺鳞癌组织中的表达均显著下调，因此选择此lncRNA作为研究对象。
对lncRNA-LET的功能研究发现，在缺氧条件下，lncRNA-LET能够抑制肝癌细胞的转移；进一步的机制研究表明在肝癌细胞中，缺氧条件促进组蛋白脱乙酰酶3 (HADC3)表达上调，引起结合在lncRNA-LET启动子区的组蛋白乙酰化减少，从而抑制lncRNA-LET的表达，lncRNA-LET的低表达导致HIF-1a表达增多，最终促进肝癌细胞转移。
为了在临床验证lncRNA-LET的表达与乙酰化的关系，研究者对12例肝癌组织和对应癌旁组织检测发现，在肝癌组织中lncRNA-LET启动子区组蛋白乙酰化水平明显减少；并且相对于非转移性肝癌组织，lncRNA-LET在转移性肝癌组织样本中表达水平显著下调。
研究意义
该研究将缺氧，lncRNA低表达，肝癌细胞转移关联在一起，系统阐述了在缺氧条件下lncRNA的表达调控机制和lncRNA对肿瘤细胞转移的调控机制，这为肿瘤治疗提供了新的方向和靶点。
原文出处
Repression of the Long Noncoding RNA-LET by Histone Deacetylase 3 Contributes to Hypoxia-Mediated Metastasis. Molecular Cell. 2013.
